262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1214 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  96.33 
 
 		 763 aa  1531    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  46.15 
 
 		 763 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  48.16 
 
 		 776 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.81 
 
 		 790 aa  660    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  44.3 
 
 		 776 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.44 
 
 		 758 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  44.17 
 
 		 776 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.03 
 
 		 762 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  100 
 
 		 763 aa  1579    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.22 
 
 		 849 aa  647    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  46.22 
 
 		 749 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  46.96 
 
 		 760 aa  705    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.52 
 
 		 780 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.16 
 
 		 758 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  44.17 
 
 		 776 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.05 
 
 		 775 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.59 
 
 		 773 aa  636    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.86 
 
 		 767 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  86.5 
 
 		 763 aa  1389    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44 
 
 		 785 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.94 
 
 		 741 aa  688    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.9 
 
 		 778 aa  675    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.71 
 
 		 756 aa  683    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.78 
 
 		 780 aa  686    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.03 
 
 		 764 aa  662    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.4 
 
 		 770 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.09 
 
 		 780 aa  684    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.13 
 
 		 773 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.44 
 
 		 751 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.97 
 
 		 779 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.15 
 
 		 785 aa  647    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.27 
 
 		 776 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.35 
 
 		 767 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.1 
 
 		 778 aa  633  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.62 
 
 		 777 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.97 
 
 		 792 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  45.19 
 
 		 740 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.44 
 
 		 773 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.23 
 
 		 773 aa  615  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.7 
 
 		 781 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.44 
 
 		 773 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.49 
 
 		 781 aa  611  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.16 
 
 		 773 aa  609  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.21 
 
 		 774 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  43.24 
 
 		 786 aa  607  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2355  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.7 
 
 		 852 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.218654 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6177  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.32 
 
 		 784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal  0.0868727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.68 
 
 		 766 aa  599  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.85 
 
 		 773 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1457  hydrogenase maturation protein HypF  45.03 
 
 		 719 aa  595  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.9 
 
 		 818 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.68 
 
 		 752 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.55 
 
 		 783 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.27 
 
 		 752 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.3 
 
 		 781 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.71 
 
 		 745 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.77 
 
 		 763 aa  580  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.01 
 
 		 758 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1945  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.46 
 
 		 816 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3979  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.88 
 
 		 756 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.55 
 
 		 775 aa  570  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.18 
 
 		 785 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  40.97 
 
 		 824 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.97 
 
 		 793 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2407  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.12 
 
 		 756 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258708 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.22 
 
 		 791 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  40.98 
 
 		 812 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01180  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.2 
 
 		 848 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0926  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.2 
 
 		 740 aa  544  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.05 
 
 		 764 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0391  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.41 
 
 		 736 aa  541  9.999999999999999e-153  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000910038  hitchhiker  0.000000117936 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  42.95 
 
 		 758 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2481  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.33 
 
 		 735 aa  538  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.59 
 
 		 809 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2550  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.74 
 
 		 818 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51841  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.67 
 
 		 762 aa  532  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2326  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.23 
 
 		 978 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.77 
 
 		 779 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.91 
 
 		 773 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.79 
 
 		 753 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40 
 
 		 766 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.74 
 
 		 781 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2551  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.01 
 
 		 770 aa  522  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.102731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.18 
 
 		 789 aa  522  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.99 
 
 		 769 aa  520  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.71 
 
 		 758 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4854  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.17 
 
 		 795 aa  519  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0382  hydrogenase maturation protein  38.06 
 
 		 767 aa  514  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.56 
 
 		 803 aa  515  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.12 
 
 		 785 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2359  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.05 
 
 		 777 aa  515  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658058  normal  0.0687846 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.56 
 
 		 803 aa  515  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0356  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  39.79 
 
 		 741 aa  511  1e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0522956  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0046  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.93 
 
 		 736 aa  509  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.890039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3880  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.37 
 
 		 778 aa  509  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.956436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.09 
 
 		 749 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1101  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.56 
 
 		 744 aa  509  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0681  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.11 
 
 		 766 aa  504  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.05 
 
 		 788 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  41.32 
 
 		 758 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>