65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4682 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4682  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1057    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  26.38 
 
 		 554 aa  93.6  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  25.35 
 
 		 684 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  28.57 
 
 		 640 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4385  Prenyltransferase/squalene oxidase  23.53 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0903  Squalene cyclase-like protein  23.13 
 
 		 697 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  27.84 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  26.47 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  24.2 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  24.89 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  24.46 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  24.47 
 
 		 668 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  22.59 
 
 		 679 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  25.75 
 
 		 644 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  28.07 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  25.09 
 
 		 719 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  24.91 
 
 		 645 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4671  Terpene synthase  24.27 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.965623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  26.24 
 
 		 737 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  27.01 
 
 		 730 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  22.84 
 
 		 688 aa  53.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  31.85 
 
 		 2528 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  28.42 
 
 		 619 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  27.01 
 
 		 730 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  27.17 
 
 		 633 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  25.88 
 
 		 663 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  26.88 
 
 		 617 aa  50.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  23.79 
 
 		 632 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  23.69 
 
 		 710 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1726  squalene cyclase  25.34 
 
 		 654 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00651785  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  25.41 
 
 		 617 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09189  squalene-hopene-cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00260)  26.18 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  25.42 
 
 		 663 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  25.14 
 
 		 663 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  25.34 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  23.47 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  22.59 
 
 		 631 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  25.86 
 
 		 654 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  24.76 
 
 		 653 aa  48.5  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  24.74 
 
 		 654 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  24.35 
 
 		 649 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  24.86 
 
 		 617 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  25.71 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1726  hypothetical protein  28.5 
 
 		 605 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117249  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  24.86 
 
 		 617 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  29.56 
 
 		 659 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  23.87 
 
 		 653 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3222  Squalene cyclase-like protein  23.16 
 
 		 660 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  22.42 
 
 		 684 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  21.51 
 
 		 679 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  24.19 
 
 		 617 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  25.37 
 
 		 741 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1904  squalene-hopene cyclase  24.81 
 
 		 705 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2017  hypothetical protein  28.78 
 
 		 593 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244716  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77382  Lanosterol synthase (Oxidosqualene--lanosterol cyclase) (2,3-epoxysqualene--lanosterol cyclase) (OSC)  31.76 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  21.65 
 
 		 679 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  27.65 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  27.07 
 
 		 617 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  24.65 
 
 		 665 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  24.43 
 
 		 662 aa  44.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0700  prenyltransferase/squalene oxidase  26.88 
 
 		 725 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0951082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  26.26 
 
 		 617 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  26.82 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  23.93 
 
 		 654 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  24.46 
 
 		 617 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>