22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1726 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1726  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1184    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117249  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  36.27 
 
 
572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1717  hypothetical protein  38.77 
 
 
574 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16563  normal  0.0120391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  33.16 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  28.78 
 
 
458 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.78 
 
 
429 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3809  hypothetical protein  27.51 
 
 
366 aa  60.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2721  hypothetical protein  31.13 
 
 
602 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00844887  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4509  hypothetical protein  24.74 
 
 
363 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0202625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  27.01 
 
 
699 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4682  hypothetical protein  28.5 
 
 
523 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297224  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  27.01 
 
 
640 aa  47.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  33.66 
 
 
554 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
651 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
657 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  36.72 
 
 
651 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2179  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.57 
 
 
353 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.978401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2117  cell wall anchor domain-containing protein  29.15 
 
 
588 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.853164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>