41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3809 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3809  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4509  hypothetical protein  41.98 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0202625  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2179  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.1 
 
 		 353 aa  209  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.978401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  33.06 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  29.46 
 
 		 572 aa  73.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1726  hypothetical protein  28.37 
 
 		 605 aa  66.6  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117249  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2117  cell wall anchor domain-containing protein  29.17 
 
 		 588 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.853164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3108  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  32.19 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2721  hypothetical protein  30.29 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00844887  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  28.8 
 
 		 644 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1026  hypothetical protein  34.86 
 
 		 683 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0776826  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3320  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.73 
 
 		 615 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  34.69 
 
 		 653 aa  52.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  28.05 
 
 		 682 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1911  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.76 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  27.6 
 
 		 678 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  31.82 
 
 		 684 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  33.66 
 
 		 687 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1717  hypothetical protein  29.64 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16563  normal  0.0120391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.84 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  33.66 
 
 		 687 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  35.71 
 
 		 649 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  32.73 
 
 		 678 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  34.13 
 
 		 710 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  31.03 
 
 		 679 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1423  hypothetical protein  27.15 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590088  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  36.84 
 
 		 680 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 683 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  35.05 
 
 		 659 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  36.84 
 
 		 680 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  28.17 
 
 		 645 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  33.71 
 
 		 684 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  31.79 
 
 		 695 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  36.67 
 
 		 640 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  29.36 
 
 		 631 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2017  hypothetical protein  30.23 
 
 		 593 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  34.07 
 
 		 643 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  34.07 
 
 		 643 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  32.99 
 
 		 663 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17430  hypothetical protein  30.15 
 
 		 400 aa  42.7  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1345 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0946  cell wall anchor domain-containing protein  34.2 
 
 		 415 aa  42.7  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191614  normal  0.389437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>