13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2295 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 429 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3108  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  40.38 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15930  hypothetical protein  43.09 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  0.327791 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1423  hypothetical protein  31.93 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590088  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3433  hypothetical protein  34.97 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4397  cell wall anchor domain-containing protein  36.4 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  29.48 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1726  hypothetical protein  34.55 
 
 		 605 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117249  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3809  hypothetical protein  28.7 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17430  hypothetical protein  29.94 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4509  hypothetical protein  27.13 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0202625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  30.91 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2179  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.22 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.978401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>