14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4397 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4397  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.01 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3433  hypothetical protein  34.09 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1423  hypothetical protein  34.13 
 
 		 350 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590088  normal  0.889028 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3108  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  37.3 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15930  hypothetical protein  36.06 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  0.327791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.51 
 
 		 2272 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.88 
 
 		 2179 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  48.61 
 
 		 830 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4509  hypothetical protein  27.24 
 
 		 363 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0202625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 771 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  43.21 
 
 		 846 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  39.51 
 
 		 778 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>