28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17430  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  800    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1345 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  56.94 
 
 		 497 aa  75.5  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  53.7 
 
 		 1056 aa  67.4  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  39.05 
 
 		 2272 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  50 
 
 		 848 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3426  hypothetical protein  43.84 
 
 		 370 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2179  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.49 
 
 		 353 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.978401 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  34.25 
 
 		 3521 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  60.24 
 
 		 2449 aa  49.7  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3108  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  27.74 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4345  hypothetical protein  38.36 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.61 
 
 		 429 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  55.56 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  34.34 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  66.67 
 
 		 2353 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  32.88 
 
 		 3472 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  32.88 
 
 		 3471 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17440  hypothetical protein  88.1 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.85248  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6888  response regulator receiver protein  49.3 
 
 		 875 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  42.11 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  38.46 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  49.02 
 
 		 5526 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  38.46 
 
 		 2136 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  38.46 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0183  hypothetical protein  36.07 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  26.97 
 
 		 3400 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  56.36 
 
 		 951 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.456228  normal  0.327791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>