34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17440 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17440  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  731    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.85248  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  55.87 
 
 		 497 aa  162  9e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17450  hypothetical protein  37.89 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.135372  normal  0.309344 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  35.52 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  59.57 
 
 		 848 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17420  hypothetical protein  33.94 
 
 		 233 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4398  hypothetical protein  42.41 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.344761  normal  0.772732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17430  hypothetical protein  88.1 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  65.29 
 
 		 2353 aa  72.4  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  41.4 
 
 		 623 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4396  hypothetical protein  37.5 
 
 		 163 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  35.48 
 
 		 752 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2294  hypothetical protein  37.59 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00049144  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  52.41 
 
 		 2449 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3432  hypothetical protein  28.57 
 
 		 287 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  43 
 
 		 495 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  39.66 
 
 		 938 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3810  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0328506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2178  hypothetical protein  28.21 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.96347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3109  hypothetical protein  32.54 
 
 		 288 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  53.7 
 
 		 1056 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3426  hypothetical protein  43.94 
 
 		 370 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1954  hypothetical protein  35.79 
 
 		 517 aa  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.960644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4345  hypothetical protein  41.79 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4835  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1168 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.391306  decreased coverage  0.000518688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  31.67 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1197  Spore coat polysaccharide biosynthesis protein predicted glycosyltransferase-like protein  27.42 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836411  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41316  predicted protein  36.36 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00180  protein kinase family protein with PASTA domain  45.34 
 
 		 951 aa  46.6  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000304613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8090  hypothetical protein  30.48 
 
 		 370 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  46.34 
 
 		 324 aa  43.9  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5651  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  40.78 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1703  hypothetical protein  33.57 
 
 		 311 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  31.67 
 
 		 3521 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>