106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3222 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3222  Squalene cyclase-like protein  100 
 
 		 660 aa  1321    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  26.88 
 
 		 679 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  27.47 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  27.62 
 
 		 688 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  28.16 
 
 		 679 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  28.26 
 
 		 679 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  30.22 
 
 		 680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  30.47 
 
 		 680 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  30.91 
 
 		 631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  27.74 
 
 		 684 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  28.4 
 
 		 632 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  32.3 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  29.65 
 
 		 710 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  28.71 
 
 		 668 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  28.75 
 
 		 654 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  27.52 
 
 		 647 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  29.43 
 
 		 667 aa  104  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  25.97 
 
 		 651 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  25.54 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  28.43 
 
 		 677 aa  101  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  29.57 
 
 		 695 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  29.11 
 
 		 654 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4671  Terpene synthase  26.58 
 
 		 637 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.965623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  27.52 
 
 		 669 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  28.54 
 
 		 640 aa  98.2  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  28.43 
 
 		 657 aa  97.8  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  28.43 
 
 		 657 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  28.43 
 
 		 657 aa  97.8  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  29.19 
 
 		 665 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  30.62 
 
 		 730 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  28.5 
 
 		 654 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  28.47 
 
 		 689 aa  95.1  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  31.31 
 
 		 645 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 651 aa  94.7  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 651 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 657 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 657 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 657 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 657 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  29.37 
 
 		 657 aa  94.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  28.12 
 
 		 657 aa  94.4  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  28.43 
 
 		 657 aa  94.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  30.28 
 
 		 730 aa  94.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  28.43 
 
 		 657 aa  94.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  28.53 
 
 		 663 aa  94  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  29.34 
 
 		 659 aa  94  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  28.12 
 
 		 657 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  27.61 
 
 		 657 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  29.71 
 
 		 663 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1944  squalene-hopene cyclase  30.38 
 
 		 667 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.89702  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  27.39 
 
 		 656 aa  91.3  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  32.77 
 
 		 719 aa  90.9  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  29.46 
 
 		 737 aa  90.5  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2220  squalene-hopene cyclase  30.06 
 
 		 667 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  27.8 
 
 		 657 aa  88.6  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1726  squalene cyclase  29.39 
 
 		 654 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00651785  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  29.11 
 
 		 653 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  25.3 
 
 		 617 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  28.8 
 
 		 654 aa  87.8  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  27.08 
 
 		 662 aa  86.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  25.3 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  25.3 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  28.48 
 
 		 654 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  38.81 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  26.55 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  28.46 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  28.61 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  25.16 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  27.36 
 
 		 663 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0012  Terpene synthase  28.8 
 
 		 678 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131219  normal  0.786968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  30.1 
 
 		 682 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1904  squalene-hopene cyclase  24.66 
 
 		 705 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  30.3 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  26.16 
 
 		 619 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  27.11 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  25.39 
 
 		 617 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  27.83 
 
 		 598 aa  77.4  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  23.91 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  29.44 
 
 		 633 aa  77  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  27.59 
 
 		 643 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  24.45 
 
 		 617 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  29.95 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  27.59 
 
 		 643 aa  76.6  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  27.05 
 
 		 678 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7029  squalene-hopene cyclase  28.48 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000008735 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  27.02 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  29.33 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  29.33 
 
 		 687 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  29.33 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  25.62 
 
 		 741 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4954  Terpene synthase:squalene cyclase  28.57 
 
 		 673 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58482  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  28.5 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  27.78 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3243  squalene-hopene cyclase  28.31 
 
 		 672 aa  70.5  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.291091 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11065  oxidosqualene:lanosterol cyclase (AFU_orthologue; AFUA_5G04080)  25.14 
 
 		 749 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77382  Lanosterol synthase (Oxidosqualene--lanosterol cyclase) (2,3-epoxysqualene--lanosterol cyclase) (OSC)  26.32 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_645  acetyl-coenzyme A synthetase  25.74 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.756147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2873  squalene cyclase family protein  36.64 
 
 		 670 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02520  lanosterol synthase, putative  25.86 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>