14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0700 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0700  prenyltransferase/squalene oxidase  100 
 
 		 725 aa  1481    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0951082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2706  hypothetical protein  37.4 
 
 		 626 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116563  normal  0.0217299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2688  prenyltransferase/squalene oxidase  30.23 
 
 		 571 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0370011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  28.06 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  30.64 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  27.36 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  26.18 
 
 		 336 aa  55.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  26.32 
 
 		 334 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  23.63 
 
 		 519 aa  48.1  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  25.53 
 
 		 446 aa  47.8  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1274  hypothetical protein  35.82 
 
 		 359 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4682  hypothetical protein  26.88 
 
 		 523 aa  44.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297224  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0362  hypothetical protein  25.13 
 
 		 601 aa  44.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.102207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  27.78 
 
 		 458 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>