15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37880 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  100 
 
 		 329 aa  682    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  51.9 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  49.05 
 
 		 336 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  47.71 
 
 		 333 aa  298  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  43.42 
 
 		 377 aa  278  7e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16932  predicted protein  28.97 
 
 		 361 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24362  predicted protein  31.31 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  27.3 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  26.2 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86397  predicted protein  27.03 
 
 		 424 aa  92.4  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02370  protein farnesyltransferase, putative  24.47 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79863  geranylgeranyltransferase beta subunit  28.33 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03780  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0700  prenyltransferase/squalene oxidase  27.36 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0951082  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05760  geranylgeranyl transferase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06710)  24.55 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.490336  normal  0.709701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>