14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_79863 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009048  PICST_79863  geranylgeranyltransferase beta subunit  100 
 
 		 382 aa  787    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05760  geranylgeranyl transferase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06710)  29.33 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.490336  normal  0.709701 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24362  predicted protein  26.56 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16932  predicted protein  25.81 
 
 		 361 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86397  predicted protein  26.69 
 
 		 424 aa  90.1  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  25.47 
 
 		 336 aa  85.5  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03780  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  26.48 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  29.52 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  26.92 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  27.3 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  26.53 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  24.21 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02370  protein farnesyltransferase, putative  20.85 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>