15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03780 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC03780  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24362  predicted protein  43.02 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79863  geranylgeranyltransferase beta subunit  30.58 
 
 		 382 aa  93.2  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  33.33 
 
 		 446 aa  92.4  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16932  predicted protein  34.2 
 
 		 361 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  33.14 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  39.31 
 
 		 333 aa  85.1  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  30.73 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  31.03 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  29.94 
 
 		 329 aa  71.6  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  31.45 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86397  predicted protein  35.25 
 
 		 424 aa  68.2  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05760  geranylgeranyl transferase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06710)  39.76 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.490336  normal  0.709701 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02370  protein farnesyltransferase, putative  25.3 
 
 		 521 aa  53.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0700  prenyltransferase/squalene oxidase  26.29 
 
 		 725 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0951082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>