14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_24362 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_24362  predicted protein  100 
 
 		 328 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03780  conserved hypothetical protein  42.77 
 
 		 227 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  34.76 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05760  geranylgeranyl transferase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06710)  30.18 
 
 		 446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.490336  normal  0.709701 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  29.43 
 
 		 377 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  31.31 
 
 		 329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  31.96 
 
 		 446 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  32.87 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16932  predicted protein  29.1 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86397  predicted protein  29.97 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  25.88 
 
 		 519 aa  90.1  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79863  geranylgeranyltransferase beta subunit  26.56 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  27.04 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02370  protein farnesyltransferase, putative  25.58 
 
 		 521 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>