13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02370 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF02370  protein farnesyltransferase, putative  100 
 
 		 521 aa  1075    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_86397  predicted protein  36.97 
 
 		 424 aa  200  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02002  CaaX farnesyltransferase beta subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI76]  34.19 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.577986 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82404  protein farnesyltransferase, beta subunit  33.33 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.386583  normal  0.138165 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16932  predicted protein  34.32 
 
 		 361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37880  Type II proteins geranylgeranyltransferase beta subunit  24.77 
 
 		 329 aa  86.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.232433 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24362  predicted protein  25.58 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17209  predicted protein  25.15 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28577  predicted protein  22.63 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03747  Rab geranylgeranyltransferase, beta subunit (AFU_orthologue; AFUA_7G04460)  23.87 
 
 		 334 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03780  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 		 227 aa  53.5  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01670  geranylgeranyltransferase beta subunit, putative  23.4 
 
 		 333 aa  51.2  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05760  geranylgeranyl transferase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06710)  26.21 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.490336  normal  0.709701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>