91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2017 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1163    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  28.47 
 
 		 719 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  27.47 
 
 		 657 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  27.11 
 
 		 657 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  27.95 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  28.49 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  27.04 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  27.04 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  27.04 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  30.46 
 
 		 654 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  28.21 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  27.9 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  26.07 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  30.04 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  24.91 
 
 		 679 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  28.09 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  28.81 
 
 		 656 aa  57  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  27.14 
 
 		 654 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  26.87 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  32.82 
 
 		 649 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  24.87 
 
 		 617 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  27.82 
 
 		 662 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  27.42 
 
 		 667 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  36.09 
 
 		 645 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  23.11 
 
 		 657 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  24.34 
 
 		 631 aa  55.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  21.79 
 
 		 617 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  28.91 
 
 		 737 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  21.79 
 
 		 617 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  21.79 
 
 		 617 aa  54.7  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  21.79 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  26.5 
 
 		 669 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  28.88 
 
 		 677 aa  53.9  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  21.79 
 
 		 617 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77382  Lanosterol synthase (Oxidosqualene--lanosterol cyclase) (2,3-epoxysqualene--lanosterol cyclase) (OSC)  30.3 
 
 		 728 aa  53.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  33.57 
 
 		 654 aa  53.5  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  26.43 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1608 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  29.1 
 
 		 689 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  25.64 
 
 		 659 aa  51.2  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  20.82 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  25.27 
 
 		 665 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  24.14 
 
 		 617 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  27.46 
 
 		 651 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  30.77 
 
 		 647 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  23.94 
 
 		 617 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  28.27 
 
 		 663 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  30.3 
 
 		 598 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4954  Terpene synthase:squalene cyclase  27.4 
 
 		 673 aa  50.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7029  squalene-hopene cyclase  28.1 
 
 		 676 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000008735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1944  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.89702  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0012  Terpene synthase  27.27 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131219  normal  0.786968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2220  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  35.29 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  27.65 
 
 		 618 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  22.88 
 
 		 679 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4385  Prenyltransferase/squalene oxidase  30.85 
 
 		 560 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  28.64 
 
 		 653 aa  48.1  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1726  squalene cyclase  28.17 
 
 		 654 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00651785  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  23.04 
 
 		 619 aa  48.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4682  hypothetical protein  27.32 
 
 		 523 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11065  oxidosqualene:lanosterol cyclase (AFU_orthologue; AFUA_5G04080)  28.99 
 
 		 749 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  33.83 
 
 		 661 aa  47.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  35.42 
 
 		 545 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  25.96 
 
 		 688 aa  47.4  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  25.67 
 
 		 684 aa  47.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  31.06 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  22.81 
 
 		 617 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  32.12 
 
 		 640 aa  47  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  31.82 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  31.06 
 
 		 687 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  25.6 
 
 		 668 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  31.06 
 
 		 683 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4671  Terpene synthase  23.37 
 
 		 637 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.965623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  31.06 
 
 		 678 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2873  squalene cyclase family protein  32.28 
 
 		 670 aa  46.2  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  30.14 
 
 		 643 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  36.51 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  26.43 
 
 		 653 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  30.14 
 
 		 643 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  29.29 
 
 		 663 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  27.81 
 
 		 678 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  26.54 
 
 		 695 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02520  lanosterol synthase, putative  27.89 
 
 		 738 aa  43.9  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08249  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 		 716 aa  43.9  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.423433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>