More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4378 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  100 
 
 
426 aa  860    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  53.76 
 
 
435 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  51.05 
 
 
428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  46.48 
 
 
428 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  47.18 
 
 
435 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  48.83 
 
 
428 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  46.17 
 
 
435 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  50.12 
 
 
428 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  48.48 
 
 
425 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  48.48 
 
 
425 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  45.31 
 
 
446 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  46.48 
 
 
446 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  48.01 
 
 
425 aa  363  3e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  44.84 
 
 
432 aa  363  3e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  47.78 
 
 
427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  43.53 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  47 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  47.78 
 
 
425 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  44.5 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  46.84 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  43.79 
 
 
433 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  43.79 
 
 
433 aa  350  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  40.61 
 
 
438 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  47.95 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  47.4 
 
 
428 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  43.19 
 
 
438 aa  319  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  39.11 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  39.61 
 
 
436 aa  295  8e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  39.02 
 
 
449 aa  295  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  41.31 
 
 
433 aa  290  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  39.16 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  39.62 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  39.18 
 
 
427 aa  278  1e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1522  trigger factor  40.59 
 
 
431 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00548401  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  38.37 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  39.53 
 
 
427 aa  273  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  37.3 
 
 
430 aa  272  9e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  36.13 
 
 
488 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  37.15 
 
 
478 aa  253  6e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0767  trigger factor  36.09 
 
 
424 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  36.45 
 
 
435 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  35.19 
 
 
435 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  35.48 
 
 
439 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  34.78 
 
 
433 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1894  trigger factor  33.02 
 
 
432 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  34.2 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  31.41 
 
 
442 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  30.18 
 
 
433 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  30.37 
 
 
485 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  30.75 
 
 
469 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.6 
 
 
500 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  29.68 
 
 
447 aa  202  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  31.03 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  30.97 
 
 
500 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  31.03 
 
 
440 aa  200  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.16 
 
 
471 aa  199  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.59 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  32.55 
 
 
429 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  32.55 
 
 
429 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2195  trigger factor  30.28 
 
 
463 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  33.67 
 
 
430 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  30.32 
 
 
460 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3235  trigger factor  32.31 
 
 
512 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.112931  normal  0.882786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  31.39 
 
 
454 aa  193  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1152  trigger factor  29.34 
 
 
450 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1528  trigger factor  30.82 
 
 
481 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156362  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0354  trigger factor  29.43 
 
 
472 aa  192  9e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  31.85 
 
 
429 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5275  trigger factor  30.05 
 
 
507 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2165  trigger factor  31.97 
 
 
484 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0536856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2587  trigger factor  31.98 
 
 
479 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl405  trigger factor, prolyl isomerase  29.76 
 
 
426 aa  189  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  30.58 
 
 
434 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  29.11 
 
 
483 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf857  trigger factor (prolyl isomerase)  30.77 
 
 
473 aa  186  5e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  28.27 
 
 
435 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  27.91 
 
 
479 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  30.54 
 
 
448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  29.74 
 
 
433 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000677902  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  28.38 
 
 
455 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  28.38 
 
 
455 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0689  trigger factor  29.26 
 
 
459 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000380818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3400  trigger factor  29.43 
 
 
481 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  27.12 
 
 
471 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  27.68 
 
 
472 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  28.27 
 
 
435 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4041  trigger factor  28.97 
 
 
473 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.248232  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0432  trigger factor-like protein  30.99 
 
 
449 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.746962  normal  0.196981 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  27.68 
 
 
472 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0882  trigger factor  28.27 
 
 
449 aa  176  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  28.81 
 
 
435 aa  176  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  28.01 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  28.31 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  33.23 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1693  trigger factor  30.72 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>