More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2248 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  648    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  46.05 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  46.43 
 
 
303 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  45.57 
 
 
305 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  45.25 
 
 
305 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  44.79 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  44.12 
 
 
310 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  41.88 
 
 
310 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.81 
 
 
332 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  49.77 
 
 
318 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 
318 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  49.54 
 
 
367 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 
318 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  41.5 
 
 
342 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  45.54 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  39.22 
 
 
326 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  46.51 
 
 
339 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  36.27 
 
 
309 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  42.34 
 
 
325 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 
306 aa  199  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.48 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  38.24 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  44.7 
 
 
327 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
310 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  37.38 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.57 
 
 
301 aa  196  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  37.38 
 
 
320 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  47.51 
 
 
326 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
302 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 
301 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  39.14 
 
 
302 aa  188  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  47.24 
 
 
247 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  44.98 
 
 
313 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  43.54 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
356 aa  181  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
313 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  36.69 
 
 
301 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  45.83 
 
 
304 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  43.69 
 
 
318 aa  180  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  45.98 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  44.6 
 
 
279 aa  180  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  40.64 
 
 
308 aa  179  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 
327 aa  178  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  36.25 
 
 
310 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  35.51 
 
 
316 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  36.39 
 
 
300 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  41.51 
 
 
323 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  42.06 
 
 
287 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  39.64 
 
 
317 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
287 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.59 
 
 
325 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  42.06 
 
 
288 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  36.33 
 
 
360 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 
303 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.7 
 
 
314 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  46.32 
 
 
247 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 
301 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
301 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  33.65 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  36.33 
 
 
342 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  41.43 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  36 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  41.42 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
302 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 
255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  38.22 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  35.13 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  39.52 
 
 
304 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  33.01 
 
 
297 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  32.89 
 
 
327 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
351 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  33.23 
 
 
316 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.57 
 
 
337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
360 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  44.34 
 
 
350 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  40.34 
 
 
347 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
311 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  41.26 
 
 
296 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  36.28 
 
 
313 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.65 
 
 
304 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  35.14 
 
 
301 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.08 
 
 
329 aa  168  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
261 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  33.33 
 
 
305 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.37 
 
 
316 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  34.73 
 
 
303 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.77 
 
 
316 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  31.65 
 
 
307 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 
297 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  37.01 
 
 
306 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.96 
 
 
315 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1333  ABC transporter related  43.18 
 
 
315 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.573564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  40.27 
 
 
319 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 
321 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>