More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1275 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  100 
 
 
199 aa  403  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  63.59 
 
 
205 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  58.71 
 
 
204 aa  261  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  57.22 
 
 
212 aa  248  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
203 aa  223  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  49.5 
 
 
205 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  50 
 
 
209 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  50.26 
 
 
200 aa  210  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.74 
 
 
208 aa  207  8e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
207 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  49.49 
 
 
200 aa  205  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  48.47 
 
 
202 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  42.86 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  42.86 
 
 
196 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  42.86 
 
 
196 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
221 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  43.75 
 
 
221 aa  180  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 
221 aa  180  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  40.29 
 
 
212 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  43.5 
 
 
198 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
230 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3035  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 
215 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0446  ABC transporter related  34.09 
 
 
264 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.051216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  38.07 
 
 
196 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3241  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.347977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3672  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
305 aa  129  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1244  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  32.81 
 
 
329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.496272  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5413  ABC transporter related  32.31 
 
 
557 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.5929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
235 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  35.9 
 
 
550 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  34.98 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0045  hypothetical protein  36.79 
 
 
207 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.372013 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  34.58 
 
 
250 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
254 aa  124  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  33.02 
 
 
233 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  35.71 
 
 
208 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  36.5 
 
 
549 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  33.02 
 
 
233 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  32.27 
 
 
541 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.38 
 
 
294 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0956  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 
339 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.960319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.93 
 
 
317 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  32.43 
 
 
612 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
260 aa  122  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  34.82 
 
 
565 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  35.82 
 
 
531 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1220  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 
349 aa  121  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.585278  normal  0.0173539 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  37.24 
 
 
248 aa  121  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 
332 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  35.2 
 
 
253 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.23 
 
 
337 aa  120  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.29 
 
 
323 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.68 
 
 
320 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  32.26 
 
 
543 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.82 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  32.02 
 
 
261 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5354  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  33.16 
 
 
324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  33.5 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.7 
 
 
337 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  35.86 
 
 
556 aa  119  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0204  ABC transporter related  37.38 
 
 
307 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.637035  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  34.01 
 
 
557 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1825  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
339 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0716  acetylglutamate semialdehyde dehydrogenase-like protein  35.11 
 
 
305 aa  119  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.699539 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.58 
 
 
558 aa  119  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  33.8 
 
 
552 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5708  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.2 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0205731  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0560  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 
334 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.204279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  34.88 
 
 
532 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  31.53 
 
 
597 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  34.13 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.68 
 
 
564 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  34.69 
 
 
258 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
333 aa  118  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
329 aa  118  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2185  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
327 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  35.64 
 
 
313 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  35.64 
 
 
313 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.51 
 
 
328 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  35.15 
 
 
257 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0213  ABC transporter related  31.28 
 
 
254 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000665889  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  34.01 
 
 
578 aa  118  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1967  ABC transporter related protein  32.83 
 
 
220 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.234063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  35.2 
 
 
258 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.52 
 
 
326 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0235  ABC transporter related  31.39 
 
 
227 aa  117  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0860423  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  33.17 
 
 
536 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.49 
 
 
328 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  34.18 
 
 
253 aa  117  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  32.82 
 
 
615 aa  117  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.04 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0619  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  33.64 
 
 
552 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0506  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.408902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1686  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.18 
 
 
340 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.62904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0453  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.67 
 
 
336 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.219882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0550  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 
320 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  34.02 
 
 
552 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>