More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2182 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.61 
 
 
622 aa  741    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.42 
 
 
620 aa  754    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
621 aa  1264    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.08 
 
 
676 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0706  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 
618 aa  569  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.437381 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  49.09 
 
 
614 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.16 
 
 
671 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.34 
 
 
637 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.6 
 
 
636 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  47.96 
 
 
608 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.66 
 
 
665 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
612 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
612 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47 
 
 
615 aa  561  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.56 
 
 
607 aa  555  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51 
 
 
656 aa  558  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.88 
 
 
651 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  47.69 
 
 
612 aa  555  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.82 
 
 
610 aa  555  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.25 
 
 
652 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.95 
 
 
621 aa  555  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  47.2 
 
 
644 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  48.91 
 
 
638 aa  552  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  49.02 
 
 
651 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
644 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
644 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  47.04 
 
 
647 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  47.2 
 
 
644 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.66 
 
 
610 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  47.04 
 
 
647 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  47.2 
 
 
647 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.71 
 
 
650 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.09 
 
 
637 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  47.04 
 
 
644 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.59 
 
 
617 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.09 
 
 
657 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  46.71 
 
 
647 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.45 
 
 
673 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  47.37 
 
 
643 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  46.55 
 
 
647 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.84 
 
 
634 aa  545  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.55 
 
 
654 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.68 
 
 
646 aa  548  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  46.55 
 
 
649 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  47.4 
 
 
644 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.33 
 
 
639 aa  548  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 
635 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  47.23 
 
 
659 aa  547  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  47.77 
 
 
660 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.63 
 
 
660 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
657 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
657 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  47.44 
 
 
658 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  46.46 
 
 
611 aa  544  1e-153  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
657 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.75 
 
 
657 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  47.78 
 
 
641 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  47.82 
 
 
616 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.32 
 
 
640 aa  544  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.06 
 
 
655 aa  544  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.57 
 
 
650 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  48.33 
 
 
693 aa  545  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.52 
 
 
640 aa  542  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1121  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.92 
 
 
652 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000570756  unclonable  0.00000000000918847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1571  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.85 
 
 
656 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000144806  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  47.99 
 
 
641 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  48.24 
 
 
644 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  46.92 
 
 
649 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.74 
 
 
620 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  47.38 
 
 
626 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  48.43 
 
 
650 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  46.78 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  47.55 
 
 
631 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  47.24 
 
 
662 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.78 
 
 
639 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  48.4 
 
 
649 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.25 
 
 
631 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.1 
 
 
627 aa  540  9.999999999999999e-153  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.41 
 
 
657 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.09 
 
 
614 aa  540  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.76 
 
 
657 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  48.28 
 
 
681 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.76 
 
 
657 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.62 
 
 
630 aa  538  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.91 
 
 
611 aa  535  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  46.65 
 
 
640 aa  535  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 
639 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.7 
 
 
645 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  46.49 
 
 
764 aa  536  1e-151  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.74 
 
 
601 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.42 
 
 
601 aa  535  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  47.09 
 
 
657 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.83 
 
 
660 aa  535  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>