More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2047 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  56.52 
 
 		 586 aa  638    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.32 
 
 		 589 aa  638    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  75.22 
 
 		 578 aa  894    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  76.74 
 
 		 576 aa  910    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  57.02 
 
 		 578 aa  674    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  56.38 
 
 		 588 aa  668    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  56.29 
 
 		 587 aa  642    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  56.53 
 
 		 582 aa  663    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  55.42 
 
 		 586 aa  644    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  57.93 
 
 		 582 aa  679    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  55.54 
 
 		 584 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  59.97 
 
 		 578 aa  692    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.99 
 
 		 585 aa  635    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 582 aa  1184    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  56.9 
 
 		 590 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  53.7 
 
 		 591 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.7 
 
 		 591 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  57.61 
 
 		 588 aa  686    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.81 
 
 		 589 aa  649    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  57.27 
 
 		 581 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  55.31 
 
 		 589 aa  661    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  55.27 
 
 		 587 aa  638    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  57.19 
 
 		 584 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.08 
 
 		 588 aa  644    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  56.12 
 
 		 588 aa  628  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  55.85 
 
 		 586 aa  625  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  53.71 
 
 		 587 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  53.51 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.12 
 
 		 576 aa  617  1e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.37 
 
 		 592 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.72 
 
 		 569 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  53.33 
 
 		 591 aa  614  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  54.26 
 
 		 586 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  54.43 
 
 		 586 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  54.26 
 
 		 586 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  50.34 
 
 		 592 aa  596  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  55.37 
 
 		 617 aa  596  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  51.1 
 
 		 618 aa  587  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  51.84 
 
 		 578 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  48.62 
 
 		 591 aa  580  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  53.71 
 
 		 579 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.91 
 
 		 586 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  53.35 
 
 		 579 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  53.83 
 
 		 579 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.52 
 
 		 623 aa  577  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  48 
 
 		 588 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.66 
 
 		 582 aa  559  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.95 
 
 		 594 aa  560  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  48.13 
 
 		 601 aa  552  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  51.13 
 
 		 591 aa  548  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  48.35 
 
 		 595 aa  538  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  49.81 
 
 		 524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  44.69 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.09 
 
 		 593 aa  513  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  44.65 
 
 		 593 aa  514  1e-144  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  45.18 
 
 		 594 aa  510  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  57.93 
 
 		 413 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.09 
 
 		 589 aa  452  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  43.5 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  43.5 
 
 		 607 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.59 
 
 		 575 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  44.73 
 
 		 589 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.85 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  41.78 
 
 		 591 aa  390  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  41.73 
 
 		 584 aa  391  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.29 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  53.11 
 
 		 1065 aa  332  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.14 
 
 		 483 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.3 
 
 		 471 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.9 
 
 		 480 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.94 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.44 
 
 		 480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  27.35 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.6 
 
 		 475 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.2 
 
 		 471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.63 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.63 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1763  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.33 
 
 		 484 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661604  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  28.65 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.15 
 
 		 468 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.56 
 
 		 472 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  28.72 
 
 		 495 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.18 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.07 
 
 		 473 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.5 
 
 		 471 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.92 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.92 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.34 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  27.19 
 
 		 479 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.1 
 
 		 486 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.19 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.28 
 
 		 475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  25.6 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.18 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.76 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.06 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.46 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  26.72 
 
 		 495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>