More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1281 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  64.06 
 
 		 584 aa  739    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  54.55 
 
 		 590 aa  640    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.67 
 
 		 586 aa  641    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.86 
 
 		 569 aa  640    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  63.7 
 
 		 578 aa  750    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  63.98 
 
 		 588 aa  771    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  55 
 
 		 588 aa  642    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 586 aa  1185    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  82.76 
 
 		 587 aa  1005    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  59.55 
 
 		 590 aa  688    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  63.29 
 
 		 588 aa  763    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  65.28 
 
 		 582 aa  765    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.86 
 
 		 589 aa  655    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  80.88 
 
 		 591 aa  960    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  59.52 
 
 		 586 aa  679    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  63.94 
 
 		 578 aa  760    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  57.63 
 
 		 586 aa  665    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  56.52 
 
 		 582 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  55.69 
 
 		 591 aa  660    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.69 
 
 		 591 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  63.2 
 
 		 586 aa  687    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  58.08 
 
 		 586 aa  673    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  59.76 
 
 		 576 aa  699    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  61.83 
 
 		 582 aa  709    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  82.28 
 
 		 587 aa  996    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  80.92 
 
 		 587 aa  975    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  58.25 
 
 		 586 aa  674    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.03 
 
 		 585 aa  663    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  64.05 
 
 		 581 aa  751    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  56.7 
 
 		 589 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  56.63 
 
 		 588 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.24 
 
 		 589 aa  626  1e-178  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.83 
 
 		 576 aa  628  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  56.07 
 
 		 584 aa  625  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.94 
 
 		 578 aa  625  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  54.41 
 
 		 588 aa  623  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.32 
 
 		 592 aa  619  1e-176  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  50.52 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  51.19 
 
 		 592 aa  596  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  48.28 
 
 		 601 aa  580  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.95 
 
 		 582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.53 
 
 		 594 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  47.76 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  52.17 
 
 		 579 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  47.83 
 
 		 595 aa  561  1e-158  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  52.09 
 
 		 579 aa  561  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  51.91 
 
 		 579 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.84 
 
 		 617 aa  556  1e-157  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  49.74 
 
 		 578 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  48.29 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  47.8 
 
 		 593 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  52.78 
 
 		 618 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  47.27 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.77 
 
 		 593 aa  543  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  45.63 
 
 		 623 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  47.01 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.17 
 
 		 575 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.14 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.14 
 
 		 607 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.23 
 
 		 413 aa  415  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  44.96 
 
 		 591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.45 
 
 		 575 aa  405  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  41.24 
 
 		 589 aa  401  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.11 
 
 		 589 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  40.32 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.62 
 
 		 587 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  48.24 
 
 		 1065 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.45 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.75 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  33.77 
 
 		 443 aa  141  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.3 
 
 		 484 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  29.2 
 
 		 458 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  35.51 
 
 		 427 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  35.51 
 
 		 438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.39 
 
 		 434 aa  137  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  37.83 
 
 		 436 aa  136  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  30.31 
 
 		 493 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.05 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.06 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.02 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.12 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.82 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.61 
 
 		 466 aa  133  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.72 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.92 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0485  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.61 
 
 		 466 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.1 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.83 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.46 
 
 		 457 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.1 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.1 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.14 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.37 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.37 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.9 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.69 
 
 		 464 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>