More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1890 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  53.37 
 
 		 592 aa  645    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  55.31 
 
 		 588 aa  668    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  61.2 
 
 		 586 aa  742    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  55.69 
 
 		 586 aa  660    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  57.41 
 
 		 578 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  73.8 
 
 		 588 aa  893    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  61.71 
 
 		 586 aa  748    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  62.56 
 
 		 586 aa  758    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  57.59 
 
 		 588 aa  688    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  60.27 
 
 		 589 aa  741    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  69.26 
 
 		 590 aa  857    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  57.07 
 
 		 582 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  56.17 
 
 		 584 aa  673    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  58.87 
 
 		 588 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  59.2 
 
 		 578 aa  715    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  61.77 
 
 		 586 aa  749    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  53.7 
 
 		 582 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  66.89 
 
 		 585 aa  833    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  57.39 
 
 		 587 aa  679    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 591 aa  1200    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  99.83 
 
 		 591 aa  1199    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.84 
 
 		 576 aa  653    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  61.88 
 
 		 586 aa  750    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  53.05 
 
 		 591 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.31 
 
 		 569 aa  815    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  66.78 
 
 		 589 aa  807    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  57.19 
 
 		 587 aa  677    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  54.37 
 
 		 576 aa  645    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  55.86 
 
 		 587 aa  661    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.44 
 
 		 592 aa  652    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  56.55 
 
 		 584 aa  666    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  53.77 
 
 		 590 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  62.52 
 
 		 582 aa  738    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  55.5 
 
 		 581 aa  654    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  70.7 
 
 		 589 aa  873    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.59 
 
 		 578 aa  657    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  55.63 
 
 		 591 aa  634  1e-180  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.37 
 
 		 586 aa  599  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 		 588 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  51.48 
 
 		 623 aa  591  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.03 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  49.5 
 
 		 618 aa  579  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  53.58 
 
 		 617 aa  578  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.57 
 
 		 594 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  49.54 
 
 		 601 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  48.81 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  51.99 
 
 		 579 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  51.44 
 
 		 579 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  51.62 
 
 		 579 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  46.62 
 
 		 593 aa  555  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  46.6 
 
 		 594 aa  550  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  49.32 
 
 		 578 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  49.2 
 
 		 595 aa  543  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  46.94 
 
 		 594 aa  543  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.83 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  46.86 
 
 		 524 aa  502  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  47.25 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  47.25 
 
 		 607 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.45 
 
 		 589 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.98 
 
 		 575 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  54.41 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  47.33 
 
 		 591 aa  437  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  44.48 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  39.9 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.61 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  51.36 
 
 		 1065 aa  327  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.33 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.19 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.77 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.77 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.11 
 
 		 484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.55 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.48 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  33.62 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  36.55 
 
 		 443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.37 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.32 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  34.41 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.02 
 
 		 479 aa  130  8.000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.78 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  29.2 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.55 
 
 		 469 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  33.6 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.92 
 
 		 480 aa  127  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  30.15 
 
 		 465 aa  127  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.5 
 
 		 468 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.5 
 
 		 468 aa  127  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21400  ATP synthase, F1 beta subunit  29.91 
 
 		 485 aa  127  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.14 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.14 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.2 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.2 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.14 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.2 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.03 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.3 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.2 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>