More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2345 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.07 
 
 
569 aa  661    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  63.29 
 
 
586 aa  763    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.29 
 
 
578 aa  681    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  64.52 
 
 
587 aa  770    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  59.62 
 
 
586 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  67.77 
 
 
578 aa  810    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.12 
 
 
588 aa  647    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  59.11 
 
 
586 aa  693    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  56.62 
 
 
591 aa  642    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.38 
 
 
576 aa  680    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  83.84 
 
 
588 aa  1040    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  80.61 
 
 
582 aa  986    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  60.72 
 
 
584 aa  717    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  56.33 
 
 
588 aa  655    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  71.18 
 
 
578 aa  840    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  55.71 
 
 
590 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  56.38 
 
 
582 aa  668    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  59.97 
 
 
586 aa  702    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
588 aa  1208    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  61.66 
 
 
591 aa  725    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  62.05 
 
 
582 aa  715    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  55.31 
 
 
591 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.31 
 
 
591 aa  668    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.22 
 
 
589 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  63.4 
 
 
587 aa  759    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.9 
 
 
586 aa  636    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  59.18 
 
 
589 aa  667    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  64.05 
 
 
576 aa  773    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  59.72 
 
 
590 aa  704    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.38 
 
 
585 aa  676    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  64 
 
 
587 aa  770    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  80.42 
 
 
581 aa  948    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.3 
 
 
592 aa  647    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  56.7 
 
 
589 aa  673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  61.51 
 
 
586 aa  717    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  83.68 
 
 
584 aa  1003    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  59.79 
 
 
586 aa  698    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  55.99 
 
 
592 aa  634  1e-180  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  56.59 
 
 
588 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.12 
 
 
594 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  52.06 
 
 
601 aa  585  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  50.51 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  53.3 
 
 
617 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  54.39 
 
 
578 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  54.22 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  54.22 
 
 
579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  54.03 
 
 
579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  50.52 
 
 
595 aa  567  1e-160  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.17 
 
 
582 aa  565  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  50.89 
 
 
593 aa  560  1e-158  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  49.91 
 
 
593 aa  556  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  50.45 
 
 
594 aa  557  1e-157  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.26 
 
 
623 aa  551  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  49.55 
 
 
594 aa  548  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  49.9 
 
 
591 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  49.32 
 
 
524 aa  515  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  42.18 
 
 
607 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  42 
 
 
607 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.72 
 
 
575 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  41.03 
 
 
584 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.91 
 
 
575 aa  429  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.53 
 
 
589 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  51.73 
 
 
413 aa  419  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  40.24 
 
 
591 aa  421  1e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.62 
 
 
589 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  43.54 
 
 
587 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  49.57 
 
 
1065 aa  333  5e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.49 
 
 
438 aa  146  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  31.49 
 
 
427 aa  146  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.18 
 
 
484 aa  139  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.88 
 
 
484 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.19 
 
 
471 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  36.93 
 
 
443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.18 
 
 
465 aa  138  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.67 
 
 
468 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.67 
 
 
468 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.18 
 
 
465 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.86 
 
 
486 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
468 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.13 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.13 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.13 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
468 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29 
 
 
458 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.57 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.4 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.12 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.57 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  28.3 
 
 
493 aa  135  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.88 
 
 
471 aa  135  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.75 
 
 
464 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.65 
 
 
475 aa  134  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.31 
 
 
480 aa  134  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1307  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.89 
 
 
491 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.04349  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  28.65 
 
 
493 aa  134  6.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.86 
 
 
469 aa  133  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>