More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1609 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.91 
 
 
589 aa  637    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  55.38 
 
 
586 aa  639    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  59.76 
 
 
582 aa  698    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  65.62 
 
 
588 aa  795    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  55.4 
 
 
589 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.09 
 
 
585 aa  645    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  64.99 
 
 
578 aa  785    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  55.38 
 
 
586 aa  640    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  59.54 
 
 
587 aa  709    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  63.28 
 
 
582 aa  778    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  57.93 
 
 
584 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  55.21 
 
 
586 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  64.75 
 
 
584 aa  768    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  66.14 
 
 
578 aa  800    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  54.87 
 
 
586 aa  641    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  64.05 
 
 
588 aa  773    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  54.37 
 
 
591 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  54.55 
 
 
591 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  63 
 
 
581 aa  744    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  59.76 
 
 
586 aa  699    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  55.86 
 
 
590 aa  651    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
576 aa  1179    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  54.95 
 
 
586 aa  645    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  58.74 
 
 
587 aa  691    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  57.69 
 
 
591 aa  670    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  60.17 
 
 
587 aa  716    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.52 
 
 
592 aa  624  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  54.71 
 
 
588 aa  621  1e-177  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.12 
 
 
589 aa  620  1e-176  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  53.12 
 
 
582 aa  617  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.38 
 
 
569 aa  617  1e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.52 
 
 
578 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.97 
 
 
576 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  53.86 
 
 
590 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.39 
 
 
588 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.77 
 
 
586 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  51.04 
 
 
601 aa  587  1e-166  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  50.36 
 
 
588 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  51.27 
 
 
591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  53.11 
 
 
592 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.09 
 
 
594 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 
595 aa  556  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  50.27 
 
 
593 aa  546  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.09 
 
 
582 aa  541  1e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  48.35 
 
 
578 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  50.8 
 
 
593 aa  543  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  51.34 
 
 
594 aa  545  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.93 
 
 
617 aa  538  9.999999999999999e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  51.02 
 
 
579 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  51.21 
 
 
579 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  50.84 
 
 
579 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  49.73 
 
 
594 aa  534  1e-150  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  47.53 
 
 
618 aa  531  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  47.38 
 
 
623 aa  527  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  47.78 
 
 
591 aa  521  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  48.28 
 
 
524 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.9 
 
 
575 aa  443  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  43.25 
 
 
607 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  43.25 
 
 
607 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  43.7 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.44 
 
 
589 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.22 
 
 
575 aa  401  9.999999999999999e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.14 
 
 
413 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.54 
 
 
587 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  42.69 
 
 
589 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  42.11 
 
 
591 aa  390  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  46.67 
 
 
1065 aa  305  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
468 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
468 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
468 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
468 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.72 
 
 
469 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.81 
 
 
464 aa  143  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.1 
 
 
434 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  33.33 
 
 
438 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.22 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
465 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.09 
 
 
473 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.43 
 
 
476 aa  134  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
465 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.22 
 
 
465 aa  134  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  32.94 
 
 
443 aa  134  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.82 
 
 
469 aa  134  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.1 
 
 
465 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.61 
 
 
484 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.58 
 
 
427 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.09 
 
 
473 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  26.71 
 
 
504 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.68 
 
 
470 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
484 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.07 
 
 
465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1298  ATP synthase F1, beta subunit  30.97 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  30.95 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>