More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1102 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  55.67 
 
 
586 aa  641    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  56.9 
 
 
582 aa  654    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  54.61 
 
 
578 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  55.83 
 
 
578 aa  652    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  100 
 
 
586 aa  1197    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.89 
 
 
592 aa  666    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.12 
 
 
594 aa  660    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  60.76 
 
 
590 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  56.15 
 
 
588 aa  683    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  55.29 
 
 
587 aa  645    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  54.9 
 
 
588 aa  636    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  55.42 
 
 
582 aa  633  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  55.02 
 
 
584 aa  629  1e-179  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  54.92 
 
 
588 aa  631  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  53.86 
 
 
587 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  57.73 
 
 
586 aa  626  1e-178  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  56.94 
 
 
590 aa  627  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  54.14 
 
 
584 aa  622  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.17 
 
 
582 aa  620  1e-176  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.31 
 
 
589 aa  620  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  54.83 
 
 
591 aa  621  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  54.25 
 
 
587 aa  620  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  53.1 
 
 
589 aa  614  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  54.62 
 
 
586 aa  611  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  52.97 
 
 
581 aa  608  1e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  56.72 
 
 
586 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  50.51 
 
 
592 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  56.34 
 
 
586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.09 
 
 
585 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  54.13 
 
 
586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.97 
 
 
588 aa  599  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  52.45 
 
 
588 aa  599  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.82 
 
 
569 aa  598  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  51.37 
 
 
591 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  51.37 
 
 
591 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  52.77 
 
 
576 aa  600  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.92 
 
 
576 aa  596  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  50.51 
 
 
591 aa  594  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  48.88 
 
 
601 aa  588  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.03 
 
 
589 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
578 aa  580  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  51.91 
 
 
582 aa  575  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  48.29 
 
 
591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  49.01 
 
 
595 aa  548  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  49.19 
 
 
579 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  48.96 
 
 
578 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  49.19 
 
 
579 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  49.01 
 
 
579 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  46.67 
 
 
618 aa  515  1.0000000000000001e-145  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  46.04 
 
 
617 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  47.06 
 
 
594 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.04 
 
 
593 aa  502  1e-141  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  46.86 
 
 
593 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  44.5 
 
 
623 aa  496  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.88 
 
 
575 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  45.89 
 
 
594 aa  496  1e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  44.32 
 
 
524 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  44.88 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  44.88 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  43.31 
 
 
575 aa  429  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.96 
 
 
587 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  43.31 
 
 
584 aa  422  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  44.28 
 
 
589 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  41.64 
 
 
589 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  41.77 
 
 
591 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.54 
 
 
413 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  48.68 
 
 
1065 aa  299  8e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  35.43 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  36.65 
 
 
443 aa  146  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  35.43 
 
 
427 aa  144  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  33.78 
 
 
442 aa  143  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  36.99 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  35.29 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  33.94 
 
 
431 aa  134  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.6 
 
 
471 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  32.51 
 
 
437 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  33.57 
 
 
442 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  32.71 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  31.99 
 
 
465 aa  127  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  34.29 
 
 
440 aa  127  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  32.64 
 
 
437 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.99 
 
 
440 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  32.48 
 
 
471 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  31.47 
 
 
446 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  35.4 
 
 
422 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.5 
 
 
480 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  33.88 
 
 
440 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.96 
 
 
468 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.96 
 
 
468 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  35.56 
 
 
442 aa  124  4e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  35.97 
 
 
443 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.22 
 
 
471 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  32.3 
 
 
446 aa  124  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.06 
 
 
473 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  34.87 
 
 
452 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
471 aa  124  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  33.6 
 
 
439 aa  124  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  31.1 
 
 
437 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  34.66 
 
 
434 aa  123  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  34.03 
 
 
433 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>