More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0961 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  56.78 
 
 
590 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  57.99 
 
 
586 aa  658    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
578 aa  1176    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.07 
 
 
585 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  58.77 
 
 
578 aa  671    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  57.66 
 
 
588 aa  684    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  60 
 
 
582 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  56.81 
 
 
584 aa  669    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  57.98 
 
 
586 aa  667    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  59.03 
 
 
578 aa  677    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  75.22 
 
 
582 aa  894    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  55.59 
 
 
591 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.59 
 
 
591 aa  656    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  57.54 
 
 
582 aa  662    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  56.91 
 
 
586 aa  645    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  88.46 
 
 
576 aa  1052    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  59.29 
 
 
588 aa  681    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  56.91 
 
 
586 aa  648    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.05 
 
 
588 aa  655    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  54.26 
 
 
587 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  62.74 
 
 
581 aa  664    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  56.12 
 
 
589 aa  666    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  58.74 
 
 
584 aa  684    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.28 
 
 
589 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  56.03 
 
 
586 aa  635    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.02 
 
 
589 aa  633  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  53.94 
 
 
586 aa  625  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  53.87 
 
 
587 aa  628  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.61 
 
 
592 aa  622  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  54.75 
 
 
588 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  53.4 
 
 
587 aa  621  1e-176  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  51.02 
 
 
591 aa  615  1e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  56.79 
 
 
592 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.52 
 
 
576 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  54.96 
 
 
569 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  53.01 
 
 
591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  52.56 
 
 
590 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  52.32 
 
 
618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50 
 
 
586 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.92 
 
 
623 aa  574  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  54.36 
 
 
579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.73 
 
 
617 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  49.74 
 
 
588 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  53.35 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  52.03 
 
 
578 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  52.98 
 
 
579 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.05 
 
 
594 aa  566  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.3 
 
 
582 aa  555  1e-157  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  48.11 
 
 
601 aa  552  1e-156  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  49.22 
 
 
591 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  51.02 
 
 
595 aa  541  9.999999999999999e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  47.51 
 
 
593 aa  536  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  45.72 
 
 
593 aa  529  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  47.24 
 
 
594 aa  531  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  47.33 
 
 
594 aa  530  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  48.85 
 
 
524 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  56.96 
 
 
413 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  45.6 
 
 
589 aa  443  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  42.34 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  42.34 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.32 
 
 
575 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.76 
 
 
589 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.19 
 
 
575 aa  414  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  37.79 
 
 
584 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.18 
 
 
587 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  40.82 
 
 
591 aa  382  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  53.59 
 
 
1065 aa  339  8e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  34.96 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  32.01 
 
 
440 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.75 
 
 
434 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  35.06 
 
 
427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  35.06 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  29.66 
 
 
504 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  34.52 
 
 
440 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  28.53 
 
 
493 aa  134  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.3 
 
 
471 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.91 
 
 
493 aa  133  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  30.84 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  33.59 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.4 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.4 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  33.1 
 
 
439 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.12 
 
 
469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  34.84 
 
 
442 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.03 
 
 
438 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  31.54 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.58 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1316  ATP synthase F1 subunit beta  30.32 
 
 
477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.768302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.26 
 
 
471 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.4 
 
 
486 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.57 
 
 
442 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  27.22 
 
 
493 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  32.62 
 
 
436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  36.08 
 
 
442 aa  127  5e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.39 
 
 
468 aa  127  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.69 
 
 
476 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.49 
 
 
484 aa  127  8.000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18200  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.52 
 
 
486 aa  126  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.234257 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  34.56 
 
 
443 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2126  ATP synthase F1, beta subunit  29.21 
 
 
472 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010229  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>