More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0422 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  100 
 
 
524 aa  1064    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  49.33 
 
 
584 aa  533  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  49.03 
 
 
582 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  49.43 
 
 
588 aa  524  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  48.96 
 
 
578 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  48.65 
 
 
578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  49.81 
 
 
582 aa  517  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  49.32 
 
 
588 aa  515  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  48.57 
 
 
590 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.14 
 
 
576 aa  511  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  52.27 
 
 
584 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.85 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  48.1 
 
 
582 aa  506  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.78 
 
 
585 aa  504  1e-141  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  46.86 
 
 
591 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  46.86 
 
 
591 aa  501  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  48.28 
 
 
576 aa  503  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  52.77 
 
 
578 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  47.83 
 
 
589 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  45.94 
 
 
589 aa  495  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.5 
 
 
589 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  47.13 
 
 
586 aa  498  1e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  50.31 
 
 
581 aa  495  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  48.36 
 
 
587 aa  493  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  49.43 
 
 
588 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  48.36 
 
 
587 aa  491  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.16 
 
 
594 aa  489  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.61 
 
 
588 aa  491  1e-137  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  47.01 
 
 
587 aa  487  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  47.01 
 
 
586 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  46.39 
 
 
591 aa  480  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.37 
 
 
569 aa  480  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.29 
 
 
592 aa  479  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  44.57 
 
 
592 aa  478  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  45.87 
 
 
586 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  45.68 
 
 
586 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  50.76 
 
 
579 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  45.68 
 
 
586 aa  473  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  50.76 
 
 
579 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  50.38 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  44.91 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.32 
 
 
586 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  44.99 
 
 
601 aa  462  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  44.26 
 
 
591 aa  459  9.999999999999999e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  44.24 
 
 
590 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.64 
 
 
582 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  44.29 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  45.01 
 
 
595 aa  441  9.999999999999999e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  42.86 
 
 
593 aa  434  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  42.88 
 
 
617 aa  433  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  42.78 
 
 
594 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  42.53 
 
 
593 aa  428  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  42.94 
 
 
623 aa  423  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  42.53 
 
 
594 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  42.47 
 
 
618 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  42.72 
 
 
591 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  40.47 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  40.66 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  40.62 
 
 
575 aa  370  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.9 
 
 
575 aa  359  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.74 
 
 
589 aa  349  7e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  40.04 
 
 
589 aa  347  4e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  39.18 
 
 
591 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  37.5 
 
 
584 aa  328  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  44.88 
 
 
413 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.3 
 
 
587 aa  317  3e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  44.92 
 
 
1065 aa  256  5e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.03 
 
 
427 aa  146  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.11 
 
 
438 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  31.45 
 
 
443 aa  144  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.82 
 
 
474 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  29.87 
 
 
434 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.53 
 
 
471 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  30.89 
 
 
433 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.73 
 
 
471 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.95 
 
 
473 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  29.11 
 
 
493 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.95 
 
 
473 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.09 
 
 
468 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.09 
 
 
468 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.48 
 
 
503 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0176  ATP synthase F1, beta subunit  31.04 
 
 
481 aa  136  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.02 
 
 
464 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 
484 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.11 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  30.62 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.11 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
468 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  32.29 
 
 
487 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
468 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  28.01 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.32 
 
 
493 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.29 
 
 
471 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.43 
 
 
471 aa  134  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>