More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27923 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  100 
 
 		 623 aa  1287    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  59.09 
 
 		 618 aa  764    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  60.7 
 
 		 617 aa  753    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  50.9 
 
 		 590 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  51.48 
 
 		 591 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  51.48 
 
 		 591 aa  591  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  50.57 
 
 		 589 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.97 
 
 		 569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  48.36 
 
 		 586 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  48.52 
 
 		 582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  52.09 
 
 		 584 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.92 
 
 		 578 aa  574  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  49.66 
 
 		 576 aa  573  1.0000000000000001e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  50.62 
 
 		 586 aa  571  1e-161  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  48.1 
 
 		 578 aa  568  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.71 
 
 		 589 aa  566  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  51.67 
 
 		 582 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  48.28 
 
 		 585 aa  561  1e-158  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  49.08 
 
 		 586 aa  558  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  48.52 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  48.57 
 
 		 586 aa  555  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  48.74 
 
 		 586 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.93 
 
 		 588 aa  553  1e-156  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  47.88 
 
 		 588 aa  555  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  47.63 
 
 		 582 aa  549  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  48.26 
 
 		 588 aa  551  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  49.73 
 
 		 592 aa  547  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  47.04 
 
 		 589 aa  547  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  50.09 
 
 		 584 aa  546  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  50.09 
 
 		 588 aa  544  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  50.45 
 
 		 590 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.47 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  50.18 
 
 		 587 aa  537  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  62.14 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  49.64 
 
 		 587 aa  533  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  48.46 
 
 		 591 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  47.38 
 
 		 576 aa  527  1e-148  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  49.46 
 
 		 587 aa  524  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  45.63 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  48.55 
 
 		 581 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  46.69 
 
 		 601 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  48.82 
 
 		 591 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.83 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  44.5 
 
 		 586 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  46.94 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  46.29 
 
 		 588 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  47.3 
 
 		 593 aa  491  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  47.27 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  47.27 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  46.63 
 
 		 582 aa  487  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  47.27 
 
 		 579 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  46.45 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  46.1 
 
 		 593 aa  481  1e-134  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  46.94 
 
 		 594 aa  482  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  45.77 
 
 		 591 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  44.4 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  42.94 
 
 		 524 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  54.57 
 
 		 1065 aa  393  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.11 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  39 
 
 		 589 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  35.59 
 
 		 591 aa  351  3e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  37.57 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  37.57 
 
 		 607 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  36.17 
 
 		 589 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  36.43 
 
 		 575 aa  328  2.0000000000000001e-88  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  37.26 
 
 		 584 aa  323  6e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.92 
 
 		 587 aa  313  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2407  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.49 
 
 		 480 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.164564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.91 
 
 		 468 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.27 
 
 		 468 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2338  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.01 
 
 		 484 aa  154  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.51 
 
 		 468 aa  154  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.51 
 
 		 468 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  29.37 
 
 		 471 aa  154  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.29 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  28.5 
 
 		 493 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0336  ATP synthase F1, beta subunit  27.6 
 
 		 480 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.320883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0653  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.38 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.903805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.23 
 
 		 464 aa  152  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.53 
 
 		 484 aa  151  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  28.35 
 
 		 487 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 		 471 aa  150  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2605  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.45 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0293594  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.82 
 
 		 467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.65 
 
 		 473 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.05 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19130  ATP synthase, F1 beta subunit  29.14 
 
 		 495 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.02 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0176  ATP synthase F1, beta subunit  27.99 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.792226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.35 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.02 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.58 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.37 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.37 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>