More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1827 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  61.95 
 
 		 589 aa  749    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 589 aa  1214    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  58.05 
 
 		 575 aa  703    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  52.09 
 
 		 607 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  51.92 
 
 		 607 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  47.16 
 
 		 587 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  48.79 
 
 		 591 aa  541  1e-153  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  46.21 
 
 		 584 aa  542  1e-153  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  45.77 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  42.3 
 
 		 588 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  44.73 
 
 		 582 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  43.26 
 
 		 585 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  43.32 
 
 		 590 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.17 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  41.59 
 
 		 578 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  40.7 
 
 		 591 aa  426  1e-118  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  43.54 
 
 		 582 aa  427  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  42.44 
 
 		 584 aa  426  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  41.67 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  40.81 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  41.44 
 
 		 590 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  40.76 
 
 		 578 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 591 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 591 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  43.7 
 
 		 588 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.69 
 
 		 569 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  41.99 
 
 		 586 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  43.85 
 
 		 581 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.6 
 
 		 576 aa  415  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.59 
 
 		 589 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.94 
 
 		 589 aa  415  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  41.64 
 
 		 586 aa  413  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  40.62 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  41.31 
 
 		 582 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  42.16 
 
 		 587 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.37 
 
 		 594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  41.13 
 
 		 587 aa  402  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  40.11 
 
 		 586 aa  402  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  40.76 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  42.26 
 
 		 587 aa  399  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  41.1 
 
 		 586 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  40.04 
 
 		 586 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  40.22 
 
 		 586 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  42.69 
 
 		 576 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  38.47 
 
 		 601 aa  392  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  39.1 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  42.69 
 
 		 591 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  42.13 
 
 		 578 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  40 
 
 		 595 aa  387  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  38.38 
 
 		 588 aa  389  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  38.96 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  40.73 
 
 		 586 aa  385  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  42.16 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  42.54 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  42.35 
 
 		 579 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  38.3 
 
 		 594 aa  373  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  38.1 
 
 		 593 aa  371  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  37.28 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  37.46 
 
 		 594 aa  367  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  40.38 
 
 		 617 aa  365  2e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  37.52 
 
 		 618 aa  360  4e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  40.74 
 
 		 524 aa  349  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  36.17 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.7 
 
 		 575 aa  323  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  42.93 
 
 		 413 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  36.91 
 
 		 1065 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  30.42 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.79 
 
 		 427 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  34.69 
 
 		 434 aa  127  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  33.33 
 
 		 440 aa  125  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  32.81 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  30.83 
 
 		 443 aa  124  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  30.27 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  33.2 
 
 		 437 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  31.92 
 
 		 439 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  30.89 
 
 		 442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  33.61 
 
 		 439 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  32.95 
 
 		 440 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  28.67 
 
 		 442 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.38 
 
 		 439 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  33.04 
 
 		 458 aa  117  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  29.18 
 
 		 439 aa  117  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  32.31 
 
 		 442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  31.79 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  28.7 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  29.43 
 
 		 439 aa  115  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  31.98 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  30.06 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  29.96 
 
 		 422 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  32.11 
 
 		 462 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  30.67 
 
 		 454 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  33.08 
 
 		 458 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  30.22 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  32.54 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  30.4 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  32.88 
 
 		 461 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  32.76 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  31.48 
 
 		 439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  29.67 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>