More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2267 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.12 
 
 		 578 aa  666    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  55.25 
 
 		 592 aa  666    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  61.68 
 
 		 582 aa  740    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  65.92 
 
 		 585 aa  808    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.79 
 
 		 576 aa  672    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  61.09 
 
 		 586 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.01 
 
 		 592 aa  664    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  67.18 
 
 		 588 aa  827    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  62.74 
 
 		 589 aa  769    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  57.8 
 
 		 587 aa  677    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  56.7 
 
 		 586 aa  667    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  58.18 
 
 		 578 aa  690    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  61.43 
 
 		 586 aa  733    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  56.7 
 
 		 588 aa  673    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  60.07 
 
 		 590 aa  660    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  57.73 
 
 		 587 aa  682    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  73.12 
 
 		 590 aa  896    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 		 589 aa  1204    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  59.61 
 
 		 582 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  57.14 
 
 		 584 aa  682    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  60.42 
 
 		 588 aa  697    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  61.26 
 
 		 586 aa  736    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  57.89 
 
 		 581 aa  658    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  59.17 
 
 		 578 aa  717    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  61.77 
 
 		 586 aa  736    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  66.25 
 
 		 569 aa  786    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  62.46 
 
 		 586 aa  765    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  55.31 
 
 		 582 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  70.7 
 
 		 591 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  70.7 
 
 		 591 aa  874    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  56.92 
 
 		 584 aa  677    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  71.04 
 
 		 589 aa  881    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  55.71 
 
 		 591 aa  638    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  57.04 
 
 		 587 aa  664    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.4 
 
 		 576 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  54.86 
 
 		 591 aa  673    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  57.61 
 
 		 588 aa  683    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  50.69 
 
 		 588 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.1 
 
 		 586 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.26 
 
 		 582 aa  608  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  52.37 
 
 		 601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.87 
 
 		 594 aa  594  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  50.76 
 
 		 618 aa  591  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  50.57 
 
 		 623 aa  588  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  49.75 
 
 		 617 aa  581  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  50 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  49.24 
 
 		 594 aa  570  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  50.51 
 
 		 579 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  50.17 
 
 		 579 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  49.06 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  53.21 
 
 		 579 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  49.75 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  48.56 
 
 		 593 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  49.4 
 
 		 578 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  49.75 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  47.83 
 
 		 524 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  45.13 
 
 		 607 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  45.33 
 
 		 607 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  43.53 
 
 		 589 aa  455  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  56.06 
 
 		 413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.38 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  42.62 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  41.19 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  42.41 
 
 		 591 aa  427  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  42.94 
 
 		 584 aa  418  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.68 
 
 		 587 aa  409  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  47.63 
 
 		 1065 aa  319  1e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  29.62 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.33 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  36.4 
 
 		 442 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.86 
 
 		 479 aa  138  4e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.3 
 
 		 484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.03 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.03 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  33.23 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.22 
 
 		 465 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  39.74 
 
 		 443 aa  136  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.56 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.03 
 
 		 484 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  31.32 
 
 		 471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.15 
 
 		 471 aa  134  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.75 
 
 		 465 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  36.19 
 
 		 427 aa  133  9e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  36.19 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.11 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  29.03 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.77 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.9 
 
 		 465 aa  130  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.61 
 
 		 493 aa  130  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.35 
 
 		 476 aa  130  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.29 
 
 		 464 aa  130  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.69 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.8 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  35.74 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.18 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.8 
 
 		 468 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  28.5 
 
 		 454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.08 
 
 		 480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.37 
 
 		 469 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>