More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0281 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  55.71 
 
 
589 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  60.07 
 
 
586 aa  659    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  80.37 
 
 
587 aa  978    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  56.41 
 
 
585 aa  667    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  61.94 
 
 
578 aa  744    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  60.07 
 
 
586 aa  659    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  60.26 
 
 
586 aa  655    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  59.52 
 
 
582 aa  684    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  56.01 
 
 
586 aa  647    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  61.59 
 
 
582 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  56.81 
 
 
584 aa  651    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  57.31 
 
 
590 aa  677    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  79.19 
 
 
587 aa  973    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  62.8 
 
 
578 aa  760    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  61.83 
 
 
588 aa  739    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  63.15 
 
 
588 aa  762    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  55.63 
 
 
591 aa  655    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  76.14 
 
 
587 aa  930    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  55.63 
 
 
591 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  80.88 
 
 
586 aa  979    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
591 aa  1198    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  57.69 
 
 
576 aa  683    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.27 
 
 
569 aa  652    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  61.58 
 
 
581 aa  729    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  55.2 
 
 
589 aa  645    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  62.98 
 
 
584 aa  735    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.83 
 
 
586 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  57.9 
 
 
586 aa  672    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.04 
 
 
576 aa  629  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  54.02 
 
 
582 aa  629  1e-179  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.77 
 
 
588 aa  627  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  55.52 
 
 
590 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.75 
 
 
589 aa  622  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.01 
 
 
578 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  55.36 
 
 
588 aa  615  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  51.95 
 
 
592 aa  609  1e-173  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  53.37 
 
 
588 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  51.56 
 
 
579 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  51.29 
 
 
579 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  51.29 
 
 
579 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  48.9 
 
 
591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  50.72 
 
 
592 aa  571  1e-161  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  49.49 
 
 
582 aa  570  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  50.26 
 
 
578 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.93 
 
 
594 aa  568  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  47.77 
 
 
601 aa  558  1e-158  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.36 
 
 
617 aa  553  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  52.21 
 
 
618 aa  548  1e-155  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  46.42 
 
 
595 aa  551  1e-155  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  46.93 
 
 
594 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  45.76 
 
 
593 aa  535  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  47.1 
 
 
593 aa  538  1e-151  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  46.34 
 
 
591 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  45.25 
 
 
594 aa  527  1e-148  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  48.82 
 
 
623 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  46.96 
 
 
524 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.1 
 
 
575 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  43.97 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  43.97 
 
 
607 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  43.12 
 
 
591 aa  420  1e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  40.1 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  52.2 
 
 
413 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.5 
 
 
575 aa  409  1e-113  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  40 
 
 
587 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  38.96 
 
 
589 aa  397  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  41.43 
 
 
589 aa  395  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  50.16 
 
 
1065 aa  309  8e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  36.32 
 
 
427 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  35.37 
 
 
438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  36.48 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  37.17 
 
 
443 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  33.84 
 
 
434 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10030  ATP synthase, F1 beta subunit  27.54 
 
 
493 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.29 
 
 
480 aa  133  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  35.06 
 
 
440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  34.66 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  29.22 
 
 
442 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.75 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.47 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0193  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.49 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.196024  normal  0.0120657 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.47 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  29.01 
 
 
458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.07 
 
 
484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  34.08 
 
 
448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.45 
 
 
470 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.53 
 
 
465 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  33.76 
 
 
450 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.09 
 
 
465 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.07 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  29.75 
 
 
471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0148  ATP synthase F1, beta subunit  28.22 
 
 
495 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.419703 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.2 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.94 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  27.68 
 
 
504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.77 
 
 
484 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.05 
 
 
465 aa  127  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.12 
 
 
470 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.12 
 
 
470 aa  127  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.3 
 
 
472 aa  127  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>