More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0287 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  61.21 
 
 
590 aa  699    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.94 
 
 
588 aa  665    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  69.34 
 
 
578 aa  826    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  64.57 
 
 
587 aa  751    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.54 
 
 
585 aa  679    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  83.68 
 
 
588 aa  1014    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  64.57 
 
 
587 aa  753    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  81.42 
 
 
582 aa  992    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  61.76 
 
 
584 aa  725    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  58.32 
 
 
588 aa  641    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  61.68 
 
 
586 aa  701    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  72.81 
 
 
578 aa  858    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.51 
 
 
592 aa  651    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  57.44 
 
 
582 aa  675    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  59.03 
 
 
589 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.41 
 
 
569 aa  670    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  56.55 
 
 
591 aa  676    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  56.55 
 
 
591 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  59.34 
 
 
578 aa  689    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  62.8 
 
 
582 aa  714    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  57.39 
 
 
589 aa  669    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  64.06 
 
 
586 aa  748    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  63.23 
 
 
576 aa  699    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  62.8 
 
 
591 aa  723    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  64.75 
 
 
576 aa  785    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  83.02 
 
 
588 aa  1013    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  61.82 
 
 
586 aa  707    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  61.17 
 
 
586 aa  700    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  61.23 
 
 
586 aa  708    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  77.34 
 
 
581 aa  911    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  57.09 
 
 
589 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  100 
 
 
584 aa  1195    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  64.22 
 
 
587 aa  750    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  61.68 
 
 
586 aa  703    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  55.13 
 
 
591 aa  634  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.31 
 
 
586 aa  628  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  57.06 
 
 
590 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  50.6 
 
 
592 aa  610  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  56.95 
 
 
588 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.8 
 
 
594 aa  590  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  51.49 
 
 
617 aa  581  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  51.83 
 
 
578 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  52.35 
 
 
582 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  54.17 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  52.84 
 
 
601 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  53.99 
 
 
579 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  50.34 
 
 
618 aa  567  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  53.8 
 
 
579 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  49.15 
 
 
595 aa  563  1.0000000000000001e-159  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  50.09 
 
 
623 aa  548  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  49.29 
 
 
593 aa  542  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  48.75 
 
 
593 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  48.31 
 
 
594 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  46.34 
 
 
594 aa  529  1e-149  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  50.66 
 
 
591 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  52.27 
 
 
524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  43.53 
 
 
607 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  43.35 
 
 
607 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  45.32 
 
 
575 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  45.99 
 
 
575 aa  439  9.999999999999999e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  46.36 
 
 
589 aa  438  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  43.03 
 
 
589 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  44.73 
 
 
587 aa  424  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  53.5 
 
 
413 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  43.17 
 
 
584 aa  420  1e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  40.81 
 
 
591 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  53.92 
 
 
1065 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  33.45 
 
 
427 aa  145  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.58 
 
 
438 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  29.17 
 
 
504 aa  139  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1218  ATP synthase F1, beta subunit  29.08 
 
 
479 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.81 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1270  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.2 
 
 
486 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.324969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  36.55 
 
 
443 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  37.29 
 
 
436 aa  137  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.04 
 
 
468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.65 
 
 
484 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  27.95 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
468 aa  136  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1072  ATP synthase F1, beta subunit  27.72 
 
 
493 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.53 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.36 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.36 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.07 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.68 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2448  ATP synthase F1, beta subunit  28.98 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.133791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  29.92 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1774  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.26 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.902314 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.27 
 
 
468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.07 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.43 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.25 
 
 
470 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.42 
 
 
464 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>