More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1691 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1102  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.89 
 
 
586 aa  666    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1630  ATP synthase, A subunit  54.02 
 
 
592 aa  688    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.173193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19400  V-type ATP synthase subunit A  53.75 
 
 
590 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0367  V-type ATP synthase subunit A  59.05 
 
 
586 aa  673    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0386  V-type ATP synthase subunit A  53.49 
 
 
578 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.938389  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0549  V-type ATP synthase subunit A  56.14 
 
 
586 aa  663    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2364  ATP synthase, A subunit  54.79 
 
 
590 aa  676    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1183  V-type ATP synthase subunit A  53.86 
 
 
582 aa  640    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.100711  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1759  V-type ATP synthase subunit A  54.4 
 
 
584 aa  647    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1770  V-type ATP synthase subunit A  51.71 
 
 
588 aa  636    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0065  V-type ATP synthase subunit A  56.41 
 
 
586 aa  669    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0298  V-type ATP synthase subunit A  58.32 
 
 
586 aa  669    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.980479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1243  V-type ATP synthase subunit A  55.61 
 
 
578 aa  661    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2345  V-type ATP synthase subunit A  54.3 
 
 
588 aa  647    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.233944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1615  V-type ATP synthase subunit A  55.82 
 
 
586 aa  667    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1890  V-type ATP synthase subunit A  53.44 
 
 
591 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.44 
 
 
591 aa  651    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.061044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1371  ATP synthase, A subunit  53.34 
 
 
587 aa  638    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2677  V-type ATP synthase subunit A  53.09 
 
 
588 aa  637    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.169554  normal  0.0660713 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0287  V-type ATP synthase subunit A  54 
 
 
584 aa  637    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1691  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  100 
 
 
592 aa  1212    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.658723 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0858  H(+)-transporting two-sector ATPase  55.3 
 
 
569 aa  638    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1262  ATP synthase, A subunit  62.64 
 
 
582 aa  725    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1501  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  54.34 
 
 
589 aa  668    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0342  V-type ATP synthase subunit A  53.9 
 
 
601 aa  645    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1917  V-type ATP synthase subunit A  54.19 
 
 
591 aa  695    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000535851  normal  0.804968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1222  V-type ATP synthase subunit A  54.23 
 
 
581 aa  636    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.264618  normal  0.308359 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2267  V-type ATP synthase subunit A  55.01 
 
 
589 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0256  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.06 
 
 
588 aa  632  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1453  H(+)-transporting two-sector ATPase  53.1 
 
 
576 aa  625  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.156481  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1686  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  50.52 
 
 
585 aa  626  1e-178  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0961  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.61 
 
 
578 aa  622  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3353  ATP synthase, A subunit  52.32 
 
 
587 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1609  V-type ATP synthase subunit A  53.52 
 
 
576 aa  624  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1281  V-type ATP synthase subunit A  52.32 
 
 
586 aa  619  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.684599  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0217  V-type ATP synthase subunit A  51.1 
 
 
595 aa  621  1e-176  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1437  V-type ATP synthase subunit A  52.5 
 
 
587 aa  617  1e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3442  V-type ATP synthase subunit A  49.14 
 
 
588 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3072  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  53.78 
 
 
589 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2047  V-type ATP synthase subunit A  51.37 
 
 
582 aa  613  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0705  V-type ATP synthase subunit A  51.06 
 
 
593 aa  610  1e-173  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00787453 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2319  V-type ATP synthase subunit A  50.53 
 
 
593 aa  605  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.31761  hitchhiker  0.000245697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1961  V-type ATP synthase subunit A  49.24 
 
 
594 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.731363  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2089  V-type ATP synthase subunit A  49.49 
 
 
594 aa  597  1e-169  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0517  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.3 
 
 
594 aa  596  1e-169  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2083  V-type ATP synthase subunit A  50.09 
 
 
591 aa  592  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.117647  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1011  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  49.66 
 
 
582 aa  590  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0281  V-type ATP synthase subunit A  51.95 
 
 
591 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02210  endodeoxyribonuclease, putative  48.32 
 
 
618 aa  558  1e-157  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.492605  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50597  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  49.74 
 
 
617 aa  551  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.353964  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27923  predicted protein  46.47 
 
 
623 aa  540  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1202  V-type ATP synthase subunit A  48.75 
 
 
579 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0700325  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2564  V-type ATP synthase subunit A  51.48 
 
 
578 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.370873 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2668  V-type ATP synthase subunit A  48.39 
 
 
579 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.367334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2763  V-type ATP synthase subunit A  48.21 
 
 
579 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0129183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0422  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit, central region  46.29 
 
 
524 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3462  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.28 
 
 
575 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.543302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2903  V-type ATP synthase subunit A  42.8 
 
 
607 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3217  V-type ATP synthase subunit A  42.8 
 
 
607 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1683  V-type ATP synthase subunit A  44.47 
 
 
589 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00187142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1827  V-type ATP synthase subunit A  40.81 
 
 
589 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08021  hypothetical protein similar to V-type H+-ATPase subunit A (Eurofung)  53.77 
 
 
413 aa  420  1e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000635616 
 
 
-
 
NC_002950  PG1803  V-type ATP synthase subunit A  41.51 
 
 
584 aa  404  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1550  H(+)-transporting two-sector ATPase  42.86 
 
 
587 aa  403  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0094  V-type ATP synthase subunit A  42.05 
 
 
575 aa  403  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0582  V-type ATP synthase subunit A  39.52 
 
 
591 aa  380  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75615  Vacuolar H+-ATPase V1 sector, subunit A  50.86 
 
 
1065 aa  314  2.9999999999999996e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.13 
 
 
471 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  31.02 
 
 
470 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.71 
 
 
471 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.61 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  31.97 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.29 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.32 
 
 
473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.48 
 
 
467 aa  135  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  31.68 
 
 
438 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.33 
 
 
458 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.61 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.89 
 
 
475 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0863  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.45 
 
 
468 aa  134  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.17 
 
 
427 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  30.53 
 
 
467 aa  133  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.99 
 
 
468 aa  133  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.06 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.87 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.95 
 
 
483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1238  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.01 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  33.43 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.74 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.74 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  33.96 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  31.01 
 
 
464 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.78 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.78 
 
 
465 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.6 
 
 
459 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  30 
 
 
484 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  28.82 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  32.6 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  29.89 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  30.17 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>