More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2773 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0123  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.6 
 
 		 534 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.22 
 
 		 473 aa  699    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.68 
 
 		 528 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.05 
 
 		 512 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1289  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.6 
 
 		 534 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.09 
 
 		 496 aa  710    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.49 
 
 		 493 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 		 474 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.68 
 
 		 489 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 483 aa  970    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.05 
 
 		 534 aa  688    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.68 
 
 		 528 aa  706    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0147  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.6 
 
 		 534 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.930772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.29 
 
 		 492 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.7 
 
 		 464 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.92 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.28 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.15 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.26 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 		 489 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  55.05 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.47 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.39 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.9 
 
 		 484 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.9 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 468 aa  508  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.73 
 
 		 462 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.51 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.15 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.07 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.78 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.21 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.52 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.29 
 
 		 470 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.37 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 		 504 aa  502  1e-141  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.09 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.73 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.63 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.25 
 
 		 475 aa  498  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.93 
 
 		 475 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  52.61 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.82 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.82 
 
 		 458 aa  499  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.36 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 518 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  53.28 
 
 		 464 aa  498  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.19 
 
 		 472 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.38 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.17 
 
 		 465 aa  500  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  52.43 
 
 		 487 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.4 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.34 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  53.56 
 
 		 470 aa  498  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.48 
 
 		 468 aa  498  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.19 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.48 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.11 
 
 		 464 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.29 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.33 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.65 
 
 		 481 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  53.03 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.27 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.45 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.86 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.4 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.24 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.68 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  52.28 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.27 
 
 		 472 aa  494  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.24 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  51.52 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 537 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.71 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 487 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.33 
 
 		 475 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.98 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.26 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  49.58 
 
 		 547 aa  485  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.4 
 
 		 459 aa  485  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 484 aa  487  1e-136  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 469 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  52.12 
 
 		 482 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>