More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3049 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.88 
 
 		 485 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.63 
 
 		 509 aa  728    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.78 
 
 		 474 aa  751    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.52 
 
 		 489 aa  806    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 		 474 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.51 
 
 		 468 aa  711    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.47 
 
 		 470 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.74 
 
 		 518 aa  760    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.95 
 
 		 474 aa  726    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.76 
 
 		 493 aa  699    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 		 537 aa  715    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 487 aa  1004    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.05 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.35 
 
 		 482 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 482 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.63 
 
 		 487 aa  500  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.92 
 
 		 482 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  51.54 
 
 		 471 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 		 489 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 465 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  51.63 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 472 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 484 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.46 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 462 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.63 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.52 
 
 		 475 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  50.43 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.45 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 475 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.43 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  50.44 
 
 		 464 aa  481  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.47 
 
 		 513 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.03 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.99 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.99 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 462 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.39 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.68 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 474 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.45 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.14 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.31 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.36 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.24 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  50 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  49.68 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.47 
 
 		 481 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.52 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.82 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.91 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0310  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.239632  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.15 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.7 
 
 		 474 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.6 
 
 		 470 aa  477  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.25 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.04 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.39 
 
 		 461 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.25 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.24 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.02 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.4 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 468 aa  472  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.95 
 
 		 487 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.97 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.58 
 
 		 482 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.61 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 463 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>