More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0952 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.84 
 
 
489 aa  790    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.57 
 
 
474 aa  766    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.77 
 
 
474 aa  777    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.82 
 
 
485 aa  739    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
474 aa  655    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.24 
 
 
468 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.43 
 
 
470 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.08 
 
 
518 aa  824    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
509 aa  1042    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.16 
 
 
537 aa  716    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.91 
 
 
493 aa  721    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.31 
 
 
487 aa  765    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.91 
 
 
462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.38 
 
 
482 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.84 
 
 
487 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.59 
 
 
483 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  50.96 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.61 
 
 
474 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 
465 aa  491  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.48 
 
 
467 aa  488  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.83 
 
 
489 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
482 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.34 
 
 
473 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  52.28 
 
 
468 aa  487  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.2 
 
 
465 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 
462 aa  486  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  50.43 
 
 
465 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 
467 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.86 
 
 
464 aa  485  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  52.3 
 
 
471 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.1 
 
 
461 aa  481  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 
465 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.03 
 
 
469 aa  483  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 
484 aa  484  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 
462 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
468 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 
462 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
472 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 
465 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.28 
 
 
513 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.18 
 
 
474 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
484 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
472 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
470 aa  480  1e-134  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 
464 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
468 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 
483 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
468 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.54 
 
 
467 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
469 aa  480  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 
465 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.47 
 
 
493 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 
483 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 
465 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.1 
 
 
483 aa  481  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 
464 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
470 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 
471 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 
459 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
469 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
469 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
469 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 
469 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
471 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.34 
 
 
488 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
470 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 
468 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
468 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
468 aa  475  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.81 
 
 
487 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
462 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2171  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.35 
 
 
487 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
470 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
503 aa  476  1e-133  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
469 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
465 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.85 
 
 
461 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.01 
 
 
486 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 
473 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.74 
 
 
481 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 
496 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.26 
 
 
475 aa  478  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 
468 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
470 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
470 aa  478  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 
461 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.62 
 
 
469 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 
472 aa  477  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.31 
 
 
476 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
465 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
471 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.67 
 
 
488 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.88 
 
 
458 aa  471  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.58 
 
 
477 aa  474  1e-132  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.01 
 
 
486 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.46 
 
 
484 aa  475  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
474 aa  475  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 
462 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
464 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.85 
 
 
471 aa  472  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>