More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1440 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 476 aa  952    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 474 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.33 
 
 		 493 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.44 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.52 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 528 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.74 
 
 		 528 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.28 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.87 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.65 
 
 		 534 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0147  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.42 
 
 		 534 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.930772  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1289  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.42 
 
 		 534 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0123  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.42 
 
 		 534 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  66 
 
 		 473 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.53 
 
 		 489 aa  571  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.84 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.84 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.93 
 
 		 462 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.21 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.08 
 
 		 467 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.99 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.75 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.71 
 
 		 462 aa  501  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.94 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.28 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.48 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.59 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  52.79 
 
 		 471 aa  494  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.7 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.95 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.07 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  52.89 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.16 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.45 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 474 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.47 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.82 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  50.93 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.96 
 
 		 465 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.84 
 
 		 487 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.9 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.69 
 
 		 470 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  52.36 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.4 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.51 
 
 		 459 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 468 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.03 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.69 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  53 
 
 		 471 aa  478  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.27 
 
 		 518 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.38 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.62 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.06 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  51.49 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  50.63 
 
 		 482 aa  475  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 		 475 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.73 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.4 
 
 		 484 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.6 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 		 537 aa  477  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.69 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.52 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 471 aa  477  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.18 
 
 		 461 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.71 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl115  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.76 
 
 		 479 aa  474  1e-132  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.97 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.07 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.06 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.5 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.01 
 
 		 485 aa  474  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 		 487 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>