More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1954 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.77 
 
 
474 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.75 
 
 
474 aa  757    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.22 
 
 
474 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.2 
 
 
468 aa  748    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.55 
 
 
509 aa  748    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.8 
 
 
470 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
489 aa  1003    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.63 
 
 
518 aa  798    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.82 
 
 
493 aa  714    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.09 
 
 
485 aa  734    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.95 
 
 
537 aa  712    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.52 
 
 
487 aa  806    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.57 
 
 
462 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  51.12 
 
 
487 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  52.68 
 
 
471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.38 
 
 
474 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.79 
 
 
482 aa  512  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.93 
 
 
467 aa  513  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 
483 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.32 
 
 
467 aa  508  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 
462 aa  509  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.89 
 
 
482 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.65 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.41 
 
 
493 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 
472 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.61 
 
 
465 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.14 
 
 
489 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.38 
 
 
468 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.82 
 
 
482 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.19 
 
 
469 aa  501  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.84 
 
 
462 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.74 
 
 
470 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.78 
 
 
475 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.38 
 
 
470 aa  499  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
468 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.7 
 
 
472 aa  501  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
464 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.16 
 
 
472 aa  498  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 
465 aa  495  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.74 
 
 
470 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.07 
 
 
468 aa  495  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 
464 aa  495  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 
465 aa  495  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 
470 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.89 
 
 
465 aa  495  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
484 aa  498  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.74 
 
 
470 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
470 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.06 
 
 
473 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
492 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 
465 aa  496  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.07 
 
 
468 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
484 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.74 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.4 
 
 
464 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.95 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.95 
 
 
470 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 
462 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16281  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.95 
 
 
486 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.210886  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 
484 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
467 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.84 
 
 
504 aa  491  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
496 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.42 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.78 
 
 
461 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
468 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.42 
 
 
475 aa  492  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
469 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.52 
 
 
473 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.47 
 
 
469 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
469 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
469 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
469 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.33 
 
 
488 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.02 
 
 
461 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 
462 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
469 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1531  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.44 
 
 
486 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
462 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.33 
 
 
488 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.28 
 
 
473 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16401  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 
486 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
462 aa  489  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 
471 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 
484 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.28 
 
 
482 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.59 
 
 
483 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.59 
 
 
483 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
468 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3415  ATP synthase F1, beta subunit  49.7 
 
 
500 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.67 
 
 
487 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 
459 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>