More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0888 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.82 
 
 		 489 aa  733    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.01 
 
 		 474 aa  700    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.28 
 
 		 485 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 493 aa  1009    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 		 474 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.9 
 
 		 468 aa  753    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  72.89 
 
 		 470 aa  661    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.12 
 
 		 518 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.45 
 
 		 474 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.05 
 
 		 537 aa  686    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.76 
 
 		 487 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.1 
 
 		 509 aa  695    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.93 
 
 		 462 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  51.31 
 
 		 471 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.38 
 
 		 482 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.96 
 
 		 482 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  51.27 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.58 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  50.33 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 465 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.34 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 489 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  49.67 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.8 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 464 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.34 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.57 
 
 		 493 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.16 
 
 		 483 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  50.32 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.82 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 473 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 468 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 472 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.71 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 470 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.24 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  50.32 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 		 473 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  50.11 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 		 473 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.81 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.17 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.02 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.71 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 464 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.04 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  48.94 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 488 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  49.24 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.88 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.47 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.47 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.71 
 
 		 474 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.9 
 
 		 474 aa  471  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3284  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 458 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18381  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.61509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.47 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.91 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0504  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0754046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.04 
 
 		 475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>