More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19670 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0123  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.49 
 
 
534 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.14 
 
 
483 aa  717    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.04 
 
 
492 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.29 
 
 
528 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.29 
 
 
528 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1289  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.49 
 
 
534 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.11 
 
 
489 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.41 
 
 
512 aa  682    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  79.44 
 
 
496 aa  727    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.82 
 
 
493 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.4 
 
 
474 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.95 
 
 
534 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0147  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.49 
 
 
534 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.930772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
473 aa  926    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
476 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.62 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.4 
 
 
464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.59 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.06 
 
 
484 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  54.35 
 
 
471 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 
468 aa  497  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.06 
 
 
489 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.41 
 
 
518 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 
484 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.41 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.23 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.47 
 
 
470 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.18 
 
 
465 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.23 
 
 
470 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.76 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.63 
 
 
504 aa  493  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.88 
 
 
470 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.04 
 
 
470 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
465 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
465 aa  490  1e-137  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.85 
 
 
482 aa  489  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.63 
 
 
462 aa  489  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.62 
 
 
468 aa  488  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.74 
 
 
462 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 
537 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  50.88 
 
 
465 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.85 
 
 
462 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.71 
 
 
474 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 
474 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.78 
 
 
485 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
465 aa  487  1e-136  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.97 
 
 
464 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.95 
 
 
462 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
465 aa  486  1e-136  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.41 
 
 
462 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 
467 aa  484  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 
465 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.69 
 
 
493 aa  483  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  51.02 
 
 
487 aa  484  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.45 
 
 
471 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.24 
 
 
471 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.15 
 
 
471 aa  480  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.98 
 
 
465 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.54 
 
 
465 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.03 
 
 
475 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.28 
 
 
475 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.76 
 
 
465 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
487 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  51.84 
 
 
470 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.97 
 
 
462 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 
472 aa  472  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.32 
 
 
481 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 
470 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.92 
 
 
474 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 
484 aa  472  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.98 
 
 
466 aa  474  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.73 
 
 
468 aa  473  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.81 
 
 
472 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1556  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.79 
 
 
458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.392782  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0073  ATP synthase F1, beta subunit  51.77 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.84 
 
 
503 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 
468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.37 
 
 
482 aa  468  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.26 
 
 
470 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 
458 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.95 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.72 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.93 
 
 
475 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0130  ATP synthase F1, beta subunit  52.62 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 
464 aa  462  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.8 
 
 
509 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.3 
 
 
468 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.48 
 
 
474 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.04 
 
 
471 aa  463  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 
474 aa  464  1e-129  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.15 
 
 
513 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  51.19 
 
 
464 aa  463  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.26 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>