More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2668 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  74.5 
 
 		 474 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.95 
 
 		 489 aa  712    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.52 
 
 		 474 aa  702    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.05 
 
 		 493 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.4 
 
 		 509 aa  678    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.48 
 
 		 468 aa  686    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.95 
 
 		 470 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.98 
 
 		 518 aa  730    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.62 
 
 		 485 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 537 aa  1111    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 		 487 aa  715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.21 
 
 		 474 aa  622  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.89 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.73 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.86 
 
 		 462 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 		 462 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.58 
 
 		 482 aa  514  1e-144  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 462 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 		 482 aa  508  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.15 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.19 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.19 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.31 
 
 		 462 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  51.51 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  51.4 
 
 		 470 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  51.42 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.72 
 
 		 482 aa  507  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  49.69 
 
 		 487 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  52.47 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 		 462 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.98 
 
 		 464 aa  504  1e-141  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.03 
 
 		 473 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.76 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.96 
 
 		 471 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.66 
 
 		 472 aa  498  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 		 462 aa  499  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.97 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.83 
 
 		 475 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.89 
 
 		 465 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.49 
 
 		 475 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.63 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  50.11 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 465 aa  495  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.37 
 
 		 474 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  52.4 
 
 		 467 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0141  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.3 
 
 		 457 aa  497  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.773497  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 		 513 aa  495  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  50.33 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.64 
 
 		 489 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.18 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 473 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4132  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.19 
 
 		 460 aa  495  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.364679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 483 aa  494  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 464 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2315  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.46 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.924902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.43 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.88 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.79 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4235  ATP synthase F1, beta subunit  51.32 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4189  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212641  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4075  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.999659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.89 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4100  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.740687  normal  0.359635 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.88 
 
 		 458 aa  490  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03560  hypothetical protein  51.32 
 
 		 460 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.495097  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 492 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4146  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4196  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4255  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 463 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4090  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.54 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>