More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1057 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 		 489 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 474 aa  950    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 		 528 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.46 
 
 		 496 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.09 
 
 		 493 aa  668    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.17 
 
 		 492 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.61 
 
 		 528 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.45 
 
 		 483 aa  677    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  70 
 
 		 473 aa  631  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 		 512 aa  633  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.53 
 
 		 476 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1289  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.14 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0123  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.14 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 		 534 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0147  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.14 
 
 		 534 aa  629  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.930772  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  66 
 
 		 464 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  66 
 
 		 464 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  55.94 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.16 
 
 		 484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.94 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.94 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.38 
 
 		 489 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.16 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.7 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.99 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.66 
 
 		 470 aa  508  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.48 
 
 		 465 aa  509  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.66 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.96 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.13 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.76 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.24 
 
 		 470 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.02 
 
 		 462 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.53 
 
 		 518 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.47 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.55 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.55 
 
 		 468 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.9 
 
 		 471 aa  501  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  54.39 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.07 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.49 
 
 		 467 aa  498  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.9 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.74 
 
 		 472 aa  501  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.41 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.01 
 
 		 474 aa  501  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.68 
 
 		 470 aa  498  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  51.63 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.37 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.04 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.88 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.8 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.88 
 
 		 475 aa  494  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.8 
 
 		 468 aa  496  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  51.98 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.37 
 
 		 537 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 487 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.05 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.59 
 
 		 466 aa  498  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.39 
 
 		 462 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.36 
 
 		 468 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  51.97 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.19 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.72 
 
 		 467 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 474 aa  494  9.999999999999999e-139  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.16 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.58 
 
 		 468 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.11 
 
 		 481 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.46 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.65 
 
 		 474 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.11 
 
 		 473 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.19 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.31 
 
 		 472 aa  488  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.5 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.81 
 
 		 471 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.85 
 
 		 479 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2957  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3968  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.07 
 
 		 482 aa  487  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3355  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3308  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.93 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.1 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.12 
 
 		 519 aa  486  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3015  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.63 
 
 		 464 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.33 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  53.75 
 
 		 485 aa  488  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.66 
 
 		 468 aa  487  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>