More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0763 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_02315  ATP synthase beta chain, mitochondrial (Eurofung)  68.18 
 
 
518 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.80478  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 
475 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 
470 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.91 
 
 
484 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.1 
 
 
476 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.37 
 
 
481 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.37 
 
 
475 aa  676    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
470 aa  655    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.29 
 
 
530 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1799  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.77 
 
 
521 aa  648    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.469261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.12 
 
 
471 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.28 
 
 
480 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.25 
 
 
507 aa  672    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
485 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.02 
 
 
476 aa  656    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.51 
 
 
475 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.99 
 
 
468 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.78 
 
 
468 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.3 
 
 
478 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
493 aa  636    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.24 
 
 
474 aa  663    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.12 
 
 
470 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  70.31 
 
 
503 aa  650    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.67 
 
 
537 aa  657    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.58 
 
 
474 aa  663    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
462 aa  639    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  71.03 
 
 
485 aa  656    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 
476 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.82 
 
 
481 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
474 aa  961    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0573  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 
507 aa  662    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.38 
 
 
474 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.53 
 
 
476 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 
517 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
474 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3941  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.73 
 
 
478 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.74 
 
 
476 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.88 
 
 
476 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
483 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.51 
 
 
475 aa  654    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.55 
 
 
474 aa  658    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2288  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.17 
 
 
513 aa  659    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.966957  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.33 
 
 
470 aa  654    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.28 
 
 
471 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.7 
 
 
470 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.59 
 
 
519 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
476 aa  655    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.85 
 
 
485 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1732  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.77 
 
 
521 aa  648    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.34 
 
 
478 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.15 
 
 
509 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.18 
 
 
484 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2802  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.23 
 
 
479 aa  636    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.472945  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.55 
 
 
484 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.49 
 
 
471 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.75 
 
 
478 aa  655    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.55 
 
 
482 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.91 
 
 
484 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.55 
 
 
484 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3458  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.93 
 
 
474 aa  646    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  65.68 
 
 
468 aa  631  1e-180  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
482 aa  631  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  67.46 
 
 
465 aa  633  1e-180  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
484 aa  628  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
467 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  66.74 
 
 
501 aa  630  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
462 aa  628  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
462 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.31 
 
 
464 aa  628  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  66.88 
 
 
465 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.38 
 
 
468 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
465 aa  627  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
465 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.53 
 
 
484 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.16 
 
 
464 aa  621  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  66.81 
 
 
464 aa  624  1e-177  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  64.14 
 
 
487 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.35 
 
 
482 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
465 aa  622  1e-177  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.32 
 
 
473 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.12 
 
 
473 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.83 
 
 
475 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.67 
 
 
465 aa  621  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
465 aa  623  1e-177  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
469 aa  621  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 
468 aa  621  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4737  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
542 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.603739  decreased coverage  0.00210198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
462 aa  621  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.03 
 
 
469 aa  622  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
465 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  64.35 
 
 
482 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
469 aa  620  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
469 aa  620  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.17 
 
 
462 aa  621  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
462 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.74 
 
 
468 aa  620  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.81 
 
 
469 aa  620  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.24 
 
 
465 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
462 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>