More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1403 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.21 
 
 
480 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.2 
 
 
493 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.88 
 
 
467 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
470 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
481 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
484 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.106818  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.03 
 
 
465 aa  769    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.72 
 
 
470 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 
463 aa  638    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0062  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 
461 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.9 
 
 
465 aa  783    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
471 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52160  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
458 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
463 aa  640    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
471 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.54 
 
 
484 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.186879 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
462 aa  640    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.36 
 
 
471 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2807  ATP synthase F1, beta subunit  68.38 
 
 
469 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.339111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4226  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
460 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 
458 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.39 
 
 
458 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.56 
 
 
482 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.933064  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  67.22 
 
 
487 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.47 
 
 
465 aa  780    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2922  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.04 
 
 
509 aa  647    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.03 
 
 
459 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 
462 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
476 aa  651    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.79 
 
 
474 aa  646    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4240  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.98 
 
 
458 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.695259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3074  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
458 aa  635    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0171  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.64 
 
 
476 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.09 
 
 
475 aa  655    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.84 
 
 
468 aa  669    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.63 
 
 
468 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1465  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.39 
 
 
478 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.58444  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
482 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.9 
 
 
465 aa  783    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
462 aa  647    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.24 
 
 
468 aa  635    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.72 
 
 
470 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  68.87 
 
 
530 aa  649    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3203  ATP synthase F1, beta subunit  68.38 
 
 
469 aa  643    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
468 aa  956    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4486  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.41 
 
 
458 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121569 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.78 
 
 
537 aa  640    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.47 
 
 
484 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.95 
 
 
473 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.31 
 
 
474 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
462 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0424  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.81 
 
 
466 aa  635    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.11 
 
 
484 aa  782    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0265  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.43 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.86 
 
 
481 aa  648    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0623  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.74 
 
 
484 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.33 
 
 
465 aa  782    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.21 
 
 
474 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1466  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
485 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0580828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0174  F0F1 ATP synthase subunit beta  69 
 
 
476 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4202  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
460 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.16362  normal  0.223697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1744  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.08 
 
 
485 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0920957  normal  0.184526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
462 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.68 
 
 
463 aa  638    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0559  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.64 
 
 
476 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1105  F0F1 ATP synthase subunit beta  71.34 
 
 
517 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0529  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.58 
 
 
476 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
470 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4607  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
458 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.32 
 
 
462 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.64 
 
 
474 aa  665    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.97 
 
 
461 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.11 
 
 
465 aa  783    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1681  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.92 
 
 
476 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.08 
 
 
519 aa  648    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3818  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.02 
 
 
474 aa  648    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.02 
 
 
472 aa  635    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.25 
 
 
484 aa  778    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1696  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.18 
 
 
457 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
460 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0938283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
463 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 
463 aa  640    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.26 
 
 
458 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.47 
 
 
463 aa  636    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  70.94 
 
 
485 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
462 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2080  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.91 
 
 
478 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.331414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3652  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.15 
 
 
478 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 
465 aa  665    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.61 
 
 
458 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.9 
 
 
458 aa  634    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.87 
 
 
475 aa  650    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0343  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.34 
 
 
483 aa  651    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0050058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.89 
 
 
484 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.75 
 
 
483 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.6 
 
 
473 aa  634    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.9 
 
 
463 aa  639    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>