More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1129 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2794  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.75 
 
 		 534 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.58 
 
 		 492 aa  705    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0147  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.52 
 
 		 534 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.930772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.67 
 
 		 483 aa  698    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0123  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.52 
 
 		 534 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.59 
 
 		 528 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  75.17 
 
 		 473 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0419  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.75 
 
 		 512 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 489 aa  971    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.59 
 
 		 528 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.24 
 
 		 496 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.82 
 
 		 493 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.71 
 
 		 474 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1289  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.52 
 
 		 534 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3929  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 464 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.114623  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4097  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00195065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.53 
 
 		 476 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.8 
 
 		 489 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  53.75 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.07 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.92 
 
 		 462 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.07 
 
 		 465 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.85 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  53.83 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.54 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.7 
 
 		 470 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.65 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.95 
 
 		 468 aa  495  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.48 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.19 
 
 		 467 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.58 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 		 458 aa  491  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 537 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.08 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 		 465 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.17 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 475 aa  490  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  52.64 
 
 		 482 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.95 
 
 		 467 aa  491  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3956  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.81 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0165608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.49 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.84 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4045  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 		 463 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.61 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  52.48 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.96 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.81 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.61 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.61 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 		 474 aa  488  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.11 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.26 
 
 		 470 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3925  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0179078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4017  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.436457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.74 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3644  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.81 
 
 		 462 aa  485  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0562091  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.145707 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.04 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.92 
 
 		 484 aa  484  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4310  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000158553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.51 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.64 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.38 
 
 		 458 aa  481  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.68 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.09 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.39 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0605714 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2148  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5431  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.81 
 
 		 458 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0763  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.36 
 
 		 474 aa  483  1e-135  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4898  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.95 
 
 		 458 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.19623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4365  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.853201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4366  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.59 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.25 
 
 		 458 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0176  F0F1 ATP synthase subunit beta  53 
 
 		 483 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.06 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5413  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5295  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.38 
 
 		 458 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.122474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.84 
 
 		 487 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.41 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.16 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>