More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1161 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  82.63 
 
 		 489 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.12 
 
 		 493 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  88.36 
 
 		 474 aa  794    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.58 
 
 		 474 aa  781    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.45 
 
 		 485 aa  744    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  70.19 
 
 		 474 aa  660    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.07 
 
 		 468 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.06 
 
 		 470 aa  719    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 518 aa  1059    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  68.98 
 
 		 537 aa  730    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.65 
 
 		 509 aa  776    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.74 
 
 		 487 aa  760    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.73 
 
 		 462 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.53 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.28 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.91 
 
 		 482 aa  500  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  53.28 
 
 		 471 aa  500  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  51.49 
 
 		 482 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  52.29 
 
 		 464 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.62 
 
 		 464 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.29 
 
 		 496 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.58 
 
 		 493 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 484 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.32 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.86 
 
 		 492 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.84 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.65 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.37 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.67 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.58 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 		 462 aa  491  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3053  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2910  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.86 
 
 		 458 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.06 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.26 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 472 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.85 
 
 		 528 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  54 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  52.81 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.08 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.75 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.61 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 484 aa  482  1e-135  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.37 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 465 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 470 aa  481  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4295  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.96 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.797845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 465 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.62 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.65 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04083  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 461 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0301285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2797  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.32 
 
 		 459 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.32 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.75 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  50.11 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.07 
 
 		 483 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  49.78 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.27 
 
 		 476 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.21 
 
 		 475 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.07 
 
 		 483 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 462 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.84 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.86 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.51 
 
 		 468 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4747  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.65 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.33 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.07 
 
 		 481 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  50.11 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.98 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3752  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 		 463 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00277276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4462  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 458 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.718336  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.72 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.05 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.87 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>