More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0435 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
462 aa  914    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.57 
 
 
489 aa  571  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.05 
 
 
487 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.73 
 
 
518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.89 
 
 
537 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.95 
 
 
485 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.32 
 
 
468 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.93 
 
 
493 aa  551  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.86 
 
 
474 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  59.6 
 
 
474 aa  547  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.12 
 
 
509 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.76 
 
 
474 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  60.71 
 
 
470 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.15 
 
 
467 aa  499  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.95 
 
 
462 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.81 
 
 
465 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.42 
 
 
472 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.99 
 
 
474 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.63 
 
 
464 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  54.92 
 
 
471 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.07 
 
 
465 aa  478  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0083  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.87 
 
 
475 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  53.25 
 
 
482 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.06 
 
 
472 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
465 aa  475  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.16 
 
 
467 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 
482 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.39 
 
 
482 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  55.88 
 
 
487 aa  477  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.83 
 
 
472 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.41 
 
 
464 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.99 
 
 
467 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.49 
 
 
471 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  52.19 
 
 
464 aa  472  1e-132  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 
468 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.16 
 
 
468 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.95 
 
 
462 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.13 
 
 
483 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.68 
 
 
469 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0512  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.71 
 
 
471 aa  471  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.399895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.06 
 
 
471 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.4 
 
 
470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.04 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.83 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.28 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 
462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.94 
 
 
475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.36 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.99 
 
 
504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1795  ATP synthase F1, beta subunit  54.74 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.74 
 
 
462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.03 
 
 
493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  51.94 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6062  ATP synthase F1, beta subunit  53.25 
 
 
481 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.74 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.19 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1181  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.55 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.186447  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3511  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.63 
 
 
468 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.63 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  51.72 
 
 
547 aa  465  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.18 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.3 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.53 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.64 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.17 
 
 
470 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.46 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0084  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.44 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.52 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.21 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3305  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.54 
 
 
459 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2452  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.28 
 
 
465 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2162  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.29 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3385  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.96 
 
 
484 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.69 
 
 
473 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  56.55 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.35 
 
 
476 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  55 
 
 
475 aa  467  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  52.19 
 
 
465 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  51.56 
 
 
462 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5599  ATP synthase F1, beta subunit  52.64 
 
 
459 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5121  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.64 
 
 
459 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 
468 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.39 
 
 
528 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.74 
 
 
492 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1522  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 
484 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000415981  hitchhiker  2.83591e-17 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  51.96 
 
 
468 aa  462  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6356  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.98 
 
 
458 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3875  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.09 
 
 
464 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.03 
 
 
468 aa  464  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.39 
 
 
528 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73240  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.98 
 
 
458 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 
470 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54086  predicted protein  50.32 
 
 
501 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0980495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.17 
 
 
470 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 
513 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3218  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.41 
 
 
519 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>