More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1021 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5430  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5482  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.73 
 
 
468 aa  635    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  77.45 
 
 
474 aa  748    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5396  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
469 aa  635    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33325e-39 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
473 aa  636    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 
470 aa  954    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5155  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
469 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0181879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4987  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
469 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5005  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
469 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.509964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3825  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.3 
 
 
464 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0949  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 
468 aa  633  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.740096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3131  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.53 
 
 
468 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5547  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.09 
 
 
469 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00288434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  67.17 
 
 
467 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5426  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
468 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0169294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5103  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
469 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.45 
 
 
473 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5524  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
468 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000704607  hitchhiker  0.000000000000621194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
470 aa  626  1e-178  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
470 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
471 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.25 
 
 
467 aa  626  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
470 aa  626  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.67 
 
 
471 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.88 
 
 
470 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.67 
 
 
471 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.6 
 
 
484 aa  619  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.68 
 
 
482 aa  620  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 
462 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.89 
 
 
462 aa  617  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  65.13 
 
 
487 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.67 
 
 
470 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.26 
 
 
469 aa  618  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0467  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.1 
 
 
475 aa  615  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.83426  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.16 
 
 
467 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.38 
 
 
472 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.47 
 
 
462 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 
465 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 
472 aa  611  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.26 
 
 
462 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.66 
 
 
470 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77492  F1F0-ATPase complex, F1 beta subunit  65.24 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.686531  normal  0.984135 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.96 
 
 
465 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  65.25 
 
 
467 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4495  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.45 
 
 
481 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632426  normal  0.0177309 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.74 
 
 
484 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1869  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.75 
 
 
466 aa  613  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.47 
 
 
468 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.04 
 
 
462 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.24 
 
 
470 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00570  conserved hypothetical protein  62.87 
 
 
547 aa  608  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0429252  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.45 
 
 
471 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.83 
 
 
462 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4791  F0F1 ATP synthase subunit beta  63 
 
 
465 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2402  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.3 
 
 
481 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.6 
 
 
472 aa  608  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2430  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.11 
 
 
458 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0681755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2382  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.06 
 
 
476 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.29 
 
 
493 aa  606  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2934  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.63 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.511404  normal  0.0433672 
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.87 
 
 
475 aa  605  9.999999999999999e-173  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.31 
 
 
464 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.47 
 
 
462 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.89 
 
 
465 aa  604  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.32 
 
 
465 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4165  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.08 
 
 
474 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.034111  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1933  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.83 
 
 
469 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2844  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.03 
 
 
475 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2177  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 
470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.104678  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.89 
 
 
465 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2139  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.76 
 
 
470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.12979  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.68 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  66.88 
 
 
469 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  63.6 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2086  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.58 
 
 
474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.531544  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  64.19 
 
 
465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2869  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.26 
 
 
458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.761227  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119590  ATP synthase beta chain, mitochondrial precursor  62.11 
 
 
530 aa  599  1e-170  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4618  ATP synthase F1, beta subunit  62.88 
 
 
470 aa  599  1e-170  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4503  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 
482 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  62.47 
 
 
468 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2587  ATP synthase F1, beta subunit  62.98 
 
 
458 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282932  normal  0.0250722 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  63.62 
 
 
464 aa  598  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0433  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.5 
 
 
476 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2299  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.08 
 
 
475 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0962572  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.6 
 
 
468 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2201  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.5 
 
 
475 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.67 
 
 
474 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0974  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.08 
 
 
475 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  62.82 
 
 
471 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4484  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.73 
 
 
482 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1709  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.48 
 
 
470 aa  595  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.118931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1273  F0F1 ATP synthase subunit beta  65.88 
 
 
468 aa  597  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0408  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.55 
 
 
480 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.364668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3150  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.32 
 
 
472 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4348  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.31 
 
 
482 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1049  F0F1 ATP synthase subunit beta  64.14 
 
 
474 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03113  F0F1 ATP synthase subunit beta  61.47 
 
 
468 aa  597  1e-169  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4130  F0F1 ATP synthase subunit beta  63.97 
 
 
463 aa  595  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.145707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>