More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2336 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0888  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.91 
 
 		 493 aa  709    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3106  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.13 
 
 		 474 aa  766    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0463  F0F1 ATP synthase subunit beta  80.95 
 
 		 485 aa  748    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2989  F0F1 ATP synthase subunit beta  69.11 
 
 		 474 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00236376  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1063  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.44 
 
 		 468 aa  724    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1661  F0F1 ATP synthase subunit beta  76.25 
 
 		 470 aa  697    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.692605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1954  F0F1 ATP synthase subunit beta  81.21 
 
 		 489 aa  772    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2336  F0F1 ATP synthase subunit beta  100 
 
 		 474 aa  963    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1161  F0F1 ATP synthase subunit beta  88.08 
 
 		 518 aa  817    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.652698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0952  F0F1 ATP synthase subunit beta  84.62 
 
 		 509 aa  763    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.137986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2668  F0F1 ATP synthase subunit beta  73.55 
 
 		 537 aa  725    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3049  F0F1 ATP synthase subunit beta  78.79 
 
 		 487 aa  748    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0435  F0F1 ATP synthase subunit beta  62.58 
 
 		 462 aa  559  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.86 
 
 		 493 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80814  normal  0.0410809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1057  F0F1 ATP synthase subunit beta  55.77 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1129  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.21 
 
 		 489 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1879  F0F1 ATP synthase subunit beta  54.27 
 
 		 496 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.744278 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2773  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.6 
 
 		 483 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270131  normal  0.934111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0063  ATP synthase F1, beta subunit  52.28 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2298  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 		 482 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0050  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.97 
 
 		 462 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0796757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1403  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.76 
 
 		 468 aa  489  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.593007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17800  ATP synthase F1, beta subunit  50.84 
 
 		 487 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19670  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.67 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0203  ATP synthase F1, beta subunit  50.98 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3736  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.1 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1939  ATP synthase F1 subunit beta  50.74 
 
 		 482 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0687  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0516039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0745  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.2 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2188  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.3 
 
 		 473 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1025  ATP synthase F1, beta subunit  50.88 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.44 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0011768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0031  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.88 
 
 		 462 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000937624  normal  0.974952 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1021  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.93 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000575487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1424  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.11 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5560  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.29 
 
 		 492 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00728168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0021  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.141679 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1525  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00013374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1440  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.53 
 
 		 476 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0290  F0F1 ATP synthase subunit beta  53.58 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00322689  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0102  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.532539  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1226  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 474 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.877196  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0142  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0029087  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0114  F0F1 ATP synthase subunit beta  50 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000729583  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1738  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.31199  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1618  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.29 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2757  ATP synthase F1, beta subunit  53.15 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1313  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455385  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0113  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.72 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0029  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.66 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2652  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.64 
 
 		 528 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1056  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.64 
 
 		 528 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0515  ATP synthase F1, beta subunit  49.34 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.197353  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2137  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.43 
 
 		 472 aa  471  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2378  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2608  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1638  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.19 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0091219  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2582  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.646569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4263  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.02 
 
 		 470 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.439057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0665  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.54 
 
 		 504 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000014903  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0603  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.11 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00132647  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0203  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.51 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.838406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4035  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.71 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000097844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1507  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.36 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3657  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.97 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2831  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3303  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.09 
 
 		 473 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3711  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.97 
 
 		 483 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.808218  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2212  ATP synthase F1, beta subunit  50.65 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2014  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3406  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.72 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.732253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_503  ATP synthase F1, beta subunit  49.24 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0039983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3415  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.53 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3170  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.93 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0197145  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0917  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 465 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00508196  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2325  ATP synthase F1, beta subunit  50.44 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0462267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6635  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.13 
 
 		 484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0663225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4072  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.95 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0521  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.42 
 
 		 468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00662178  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0985  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.22 
 
 		 471 aa  465  9.999999999999999e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.339538  normal  0.476467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0049  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.78 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0564  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.67 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.257197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1556  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.43 
 
 		 458 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.392782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3950  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.49 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0272  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.56 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0253839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0606  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.15 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0048  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.21 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2599  ATP synthase F1, beta subunit  50.87 
 
 		 470 aa  467  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0757842  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4106  ATP synthase F1, beta subunit  49.14 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7380  F0F1 ATP synthase subunit beta  48.18 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2195  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.55 
 
 		 470 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0325  F0F1 ATP synthase subunit beta  52.47 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0538  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.24 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.120643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5090  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.82 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1265  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.77 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5018  F0F1 ATP synthase subunit beta  50.85 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2024  F0F1 ATP synthase subunit beta  49.36 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.531003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0970  F0F1 ATP synthase subunit beta  51.18 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0459  F0F1 ATP synthase subunit beta  47.84 
 
 		 507 aa  463  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00202199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>